More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1348 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 120 aa  233  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  94.17 
 
 		 120 aa  224  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  84.17 
 
 		 120 aa  200  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  86.67 
 
 		 120 aa  197  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 		 120 aa  173  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1180  50S ribosomal protein L18  83.33 
 
 		 120 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1217  50S ribosomal protein L18  82.5 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1972  50S ribosomal protein L18  81.67 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000177032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  75 
 
 		 119 aa  170  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 		 120 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  166  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  74.17 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  63.33 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  65 
 
 		 120 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  78.35 
 
 		 120 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  77.32 
 
 		 120 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  66.96 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  64.17 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  78.35 
 
 		 120 aa  147  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  66.96 
 
 		 120 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  66.95 
 
 		 118 aa  147  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  66.96 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  75.53 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  71.88 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  60 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  74.74 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55.56 
 
 		 121 aa  136  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1930  ribosomal protein L18  69.17 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  71.68 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  69.47 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0775  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.292736  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  59.48 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 120 aa  122  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  121  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 122 aa  120  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 121 aa  120  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  61.34 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1265  50S ribosomal protein L18  64.71 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  64.58 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  47.5 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  49.17 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  54.4 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  56.84 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>