More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1341 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
79 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  98.73 
 
 
79 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  92.31 
 
 
78 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  87.18 
 
 
78 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 
80 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 
80 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  76.92 
 
 
80 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 
80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  78.38 
 
 
80 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 
82 aa  123  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  76 
 
 
80 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  73.75 
 
 
81 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  72.15 
 
 
80 aa  120  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 
80 aa  119  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 
80 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  73.33 
 
 
80 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  74.03 
 
 
82 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  72 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  68.42 
 
 
76 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  70.13 
 
 
82 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 
82 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  68.83 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  65.33 
 
 
76 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  67.95 
 
 
78 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  66.22 
 
 
76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 
82 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 
82 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 
82 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 
87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
86 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
85 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  64.94 
 
 
88 aa  106  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
88 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  63.51 
 
 
79 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
79 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  67.12 
 
 
83 aa  101  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  61.54 
 
 
92 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 
90 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2610  30S ribosomal protein S17  58.67 
 
 
97 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000173593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  60.56 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
107 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2248  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  61.97 
 
 
94 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  61.76 
 
 
89 aa  88.2  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  60.56 
 
 
85 aa  87  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  59.7 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0224  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  59.42 
 
 
89 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0431  30S ribosomal protein S17  59.7 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000081271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  62.12 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1129  30S ribosomal protein S17  56 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0049809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1964  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0367  30S ribosomal protein S17  59.09 
 
 
98 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0088  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
88 aa  84.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0650166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0669  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
87 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0804541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  67.57 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1120  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19941  30S ribosomal protein S17  57.35 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  60 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  53.62 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  52.78 
 
 
86 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  53.52 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  63.51 
 
 
86 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  51.32 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1194  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.073144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1756  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.196016  normal  0.382259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  54.93 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  51.32 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2451  30S ribosomal protein S17  58.21 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.20438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  56.52 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2324  30S ribosomal protein S17  54.17 
 
 
89 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000113865  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3813  30S ribosomal protein S17  53.52 
 
 
84 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000352623  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3434  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
90 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0295981  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  57.75 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1920  30S ribosomal protein S17  62.12 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.826822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  53.52 
 
 
88 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  59.15 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2223  30S ribosomal protein S17  60.61 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.951582  normal  0.794198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>