More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1296 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1388  DNA protecting protein DprA  93.95 
 
 		 380 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1296  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 380 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.857359  decreased coverage  0.000779051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1759  DNA protecting protein DprA  71.32 
 
 		 383 aa  551  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0933  DNA protecting protein DprA  71.28 
 
 		 383 aa  539  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339365  normal  0.657052 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3669  DNA protecting protein DprA  59.2 
 
 		 388 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215267  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0602  DNA processing protein DprA, putative  56.88 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0567  SMF protein  56.62 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2244  DNA processing protein DprA, putative  57.77 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441275  normal  0.282732 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0842  DNA protecting protein DprA  51.44 
 
 		 396 aa  388  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0234041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1356  DNA protecting protein DprA  59.89 
 
 		 378 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3916  DNA protecting protein DprA  58.38 
 
 		 378 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3031  DNA processing protein DprA, putative  57.26 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.461494  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2285  DNA processing protein DprA, putative  57.65 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4729  DNA processing chain A (DprA/Smf)  56.99 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2010  SMF protein  57.38 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.272582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3531  DNA protecting protein DprA  57.68 
 
 		 378 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2421  DNA processing protein DprA, putative  57.91 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2833  DNA protecting protein DprA  56.1 
 
 		 372 aa  347  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3315  DNA protecting protein DprA  52.16 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451996  normal  0.725027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3638  DNA protecting protein DprA  52.03 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3313  DNA protecting protein DprA  50.64 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3515  DNA protecting protein DprA  49.5 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.567424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3421  DNA protecting protein DprA  45.06 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.143035  normal  0.697351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0474  DNA protecting protein DprA  48.63 
 
 		 403 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652717  normal  0.262413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3857  DNA protecting protein DprA  46.76 
 
 		 422 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4345  DNA protecting protein DprA  51.15 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1209  DNA processing protein DprA, putative  48.11 
 
 		 360 aa  302  7.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3194  SMF protein  46.52 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1801  DNA processing protein DprA, putative  45.87 
 
 		 375 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10636  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  45.75 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3825  DNA protecting protein DprA  50.95 
 
 		 592 aa  276  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188675  normal  0.0366246 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  38.32 
 
 		 374 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3158  DNA processing protein DprA, putative  47.89 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0883  putative DNA processing protein DprA  38.34 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.430936  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2338  DNA processing protein DprA, putative  44.5 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  43.41 
 
 		 387 aa  265  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0730  DNA protecting protein DprA  45.68 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1138  DNA protecting protein DprA  44.69 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.823359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1644  DNA protecting protein DprA  43.8 
 
 		 395 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.263138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2317  DNA protecting protein DprA  46.01 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0092  DNA processing chain A  36.32 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0388  putative DNA processing protein DprA  36.56 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0849  DNA protecting protein DprA  46.7 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4323  DNA protecting protein DprA  42.23 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2177  hypothetical protein  46.35 
 
 		 372 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  40.78 
 
 		 371 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3661  DNA protecting protein DprA  38.15 
 
 		 365 aa  210  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.34529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  40.05 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.73 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  40.51 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  39.56 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  37.1 
 
 		 370 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.87 
 
 		 364 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  38.54 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  35.52 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1528  DNA protecting protein DprA  40.45 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42126e-31 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0103  DNA protecting protein DprA  36.61 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  39.55 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0599  DNA protecting protein DprA  39.24 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  38.33 
 
 		 388 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  39.61 
 
 		 359 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  37.54 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  37.85 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  38.42 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  37.95 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  36.66 
 
 		 448 aa  193  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  38.29 
 
 		 475 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0890  DNA protecting protein DprA  36.06 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.135631  normal  0.947282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  36.99 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  39.59 
 
 		 336 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  37.79 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  38.78 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  36.79 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  37.47 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  36.9 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  36.74 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  37.47 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  36.84 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  38.04 
 
 		 475 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  39.39 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  42.66 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  38.69 
 
 		 369 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  33.51 
 
 		 362 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  39.41 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  34.06 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3341  DNA processing protein DprA, putative  34.23 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0567  DNA protecting protein DprA  35.23 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  36.34 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  39.25 
 
 		 331 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  36.75 
 
 		 364 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0168  DNA protecting protein DprA  37.68 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  39.07 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  40.21 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  35.16 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  41.26 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  38.61 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  33.33 
 
 		 372 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  38.61 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  36.87 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>