More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1250 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1250  histone family protein DNA-binding protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1341  histone family protein DNA-binding protein  98.9 
 
 		 91 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0875  histone family protein DNA-binding protein  83.33 
 
 		 90 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.757232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1172  histone-like DNA-binding protein  77.78 
 
 		 90 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1701  HU-like DNA-binding protein alpha subunit  87.78 
 
 		 91 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  74.73 
 
 		 91 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  73.63 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  72.53 
 
 		 91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  62.22 
 
 		 91 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0550  DNA-binding protein HU-beta  62.22 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0799  histone-like DNA-binding protein  60 
 
 		 90 aa  110  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0045  histone family protein DNA-binding protein  57.78 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  59.55 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  0.000000000000265027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  59.55 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  59.55 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000552537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  60.23 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000296782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000512711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  57.3 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000325838  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2014  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000105311  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  57.95 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00000854913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1010  nucleoid protein Hbs  57.95 
 
 		 91 aa  100  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.301873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1362  histone-like DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0083  DNA-binding protein HU (DNA-binding protein II)  55.06 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2063  HU family DNA-binding protein  52.75 
 
 		 91 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.832344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000201993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2846  DNA-binding protein HU-alpha  52.22 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1909  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002182  DNA-binding protein HU-alpha  52.22 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1626  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000133039  hitchhiker  0.00000000638901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3327  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 94 aa  97.4  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.0697763 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0600  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  97.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2650  DNA-binding protein HU  51.69 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4353  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  55.56 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00213  DNA-binding protein  51.11 
 
 		 101 aa  95.9  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3731  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1873  HU family DNA-binding protein  53.33 
 
 		 91 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.972501  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1910  histone family protein DNA-binding protein  54.44 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000311196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0914  DNA-binding protein HU  53.33 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.196839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1035  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00000557803  hitchhiker  0.00000000462139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0942  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1014  histone family protein DNA-binding protein  52.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2292  nucleoid protein Hbs  52.22 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0430  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.719598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000024611  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000417185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3218  DNA-binding protein HU alpha subunit  51.11 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.585838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1686  DNA-binding protein HU-beta, NS1(HU-1)  52.22 
 
 		 90 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.460310000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10570  histone family protein DNA-binding protein  52.04 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0184  DNA-binding protein HU 1  51.69 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  49.44 
 
 		 92 aa  93.6  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0022  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00102315  hitchhiker  0.000567997 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1611  nucleoid protein HU beta subunit  51.11 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0687  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105584  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  52.22 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000377509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  50.57 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  57.14 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1187  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2621  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.348082  normal  0.0833374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1674  histone-like DNA-binding protein  56.04 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.171237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1608  histone-like DNA-binding protein  54.95 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.49082e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000326644  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  56.18 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000192025  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2879  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03877  HU, DNA-binding transcriptional regulator, alpha subunit  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.380115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3994  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2463  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0228112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03830  hypothetical protein  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.485291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4491  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0852675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4448  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.302586  hitchhiker  0.00101008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4543  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.440082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  53.85 
 
 		 91 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5469  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.129609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4025  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0158227 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3532  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0183  DNA-binding protein HU 1  49.44 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000296943  hitchhiker  2.26878e-36 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4234  transcriptional regulator HU subunit alpha  48.31 
 
 		 90 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>