138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1084 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  100 
 
 
84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  95.24 
 
 
84 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  66.67 
 
 
86 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  63.41 
 
 
85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.54 
 
 
85 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  60.98 
 
 
83 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.42 
 
 
85 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.42 
 
 
85 aa  104  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.54 
 
 
83 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  58.54 
 
 
83 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.54 
 
 
83 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  56.1 
 
 
83 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  58.54 
 
 
83 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
83 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1360  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2876  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.784142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3715  molybdopterin converting factor, subunit 1  54.88 
 
 
83 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  50 
 
 
83 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  53.66 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.44 
 
 
83 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.56 
 
 
83 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1977  molybdopterin synthase subunit MoaD  53.66 
 
 
83 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  49.38 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.81 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.91 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  52.44 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.43 
 
 
82 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.68 
 
 
83 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.24 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.68 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  41.98 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  41.98 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.8 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.74 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.48 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.88 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.37 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.37 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.15 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.15 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  37.04 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.44 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.44 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.93 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 
85 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  34.52 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.8 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0899  molybdopterin synthase small subunit  34.52 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  34.52 
 
 
81 aa  53.9  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.35 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.57 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0840  molybdopterin synthase small subunit  33.33 
 
 
81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  33.33 
 
 
81 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.37 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  29.63 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  34.52 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.93 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.71 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.1 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  32.14 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.14 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5395  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0296578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.18 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  35.71 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2834  molybdopterin synthase small subunit  32.14 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1436  molybdopterin synthase small subunit  32.14 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2920  molybdopterin synthase small subunit  32.14 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00751  molybdopterin synthase, small subunit  32.56 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00768  hypothetical protein  32.56 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  32.14 
 
 
83 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  30.95 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
83 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0807  molybdopterin synthase small subunit  32.56 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0028903  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3054  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.95 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2168  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.76 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  29.27 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2858  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.4 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  30.95 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  28.57 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2568  molybdopterin synthase small subunit  31.4 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0481357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2859  molybdopterin synthase small subunit  31.4 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512305  hitchhiker  0.00418424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>