More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1047 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  53.16 
 
 		 284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 276 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  37.69 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  33.46 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  32.97 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  34.43 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.84 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 312 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  35.54 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.32 
 
 		 278 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 278 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  30.99 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  37.15 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 303 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  34.65 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  35.36 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  32.02 
 
 		 283 aa  136  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  35.91 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  39.77 
 
 		 355 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  31.3 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 276 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 308 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 432 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 432 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 432 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.11 
 
 		 432 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>