More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0990 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  100 
 
 		 159 aa  322  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  96.86 
 
 		 159 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  88.46 
 
 		 158 aa  286  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  86.16 
 
 		 159 aa  263  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  71.97 
 
 		 158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  73.25 
 
 		 158 aa  237  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  72.61 
 
 		 158 aa  233  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  72.79 
 
 		 155 aa  226  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  71.07 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  69.18 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  70.75 
 
 		 158 aa  221  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  69.81 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  70.95 
 
 		 157 aa  220  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  68.55 
 
 		 157 aa  220  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  66.88 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  68.55 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  67.57 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  66.23 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  67.57 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  68.24 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  63.06 
 
 		 160 aa  206  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  64.19 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  63.52 
 
 		 157 aa  197  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  65.54 
 
 		 157 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  62.76 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  61.64 
 
 		 157 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  58.13 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 157 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  61.01 
 
 		 157 aa  187  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  58.39 
 
 		 165 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  61.01 
 
 		 157 aa  187  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  60.81 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  60.96 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  58.33 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  62.42 
 
 		 152 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  57.86 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  59.46 
 
 		 157 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 149 aa  171  5e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 148 aa  167  7e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  57.53 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.29 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 162 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  52.94 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  56.55 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  54.68 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  54.68 
 
 		 150 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  57.75 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  50.98 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 168 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  53.79 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  50 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  52.78 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  52.38 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  47.1 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  53.47 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  58.59 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09086  SsrA-binding protein  48.98 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  52.11 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 155 aa  150  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  53.9 
 
 		 167 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  55.48 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.08 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  49.68 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2134  SsrA-binding protein  48.94 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  49.31 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  52.08 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  50.33 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  53.15 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  53.24 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.39 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5661  SsrA-binding protein  44.97 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.409469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  53.1 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  49.04 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  49.03 
 
 		 155 aa  144  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>