42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0970 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  85.14 
 
 
148 aa  263  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  44.59 
 
 
148 aa  141  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  47.45 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  39.19 
 
 
148 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  39.73 
 
 
151 aa  110  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  36.49 
 
 
163 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  38.73 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  38.62 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  35.37 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  36.73 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  33.57 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  33.57 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  43.42 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  30.07 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  28.87 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  31.47 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.57 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  31.54 
 
 
148 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  29.01 
 
 
132 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  34.81 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  29.2 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  31.65 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  29.86 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  29.86 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  28.97 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  41.54 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  28.37 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  23.08 
 
 
147 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  27.14 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2693  hypothetical protein  27.33 
 
 
164 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  29.5 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  27.03 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  26.8 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  24.03 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6901  hypothetical protein  26.28 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984324  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  26.62 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2451  hypothetical protein  28.36 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.616886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1048  hypothetical protein  31.82 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0693  hypothetical protein  22.56 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3010  hypothetical protein  24.82 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>