89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0898 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  100 
 
 
353 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  94.89 
 
 
352 aa  631  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  75.95 
 
 
348 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  65.94 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  62.61 
 
 
374 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  61.9 
 
 
376 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  63.61 
 
 
354 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  61.01 
 
 
349 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  60.18 
 
 
357 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  62.07 
 
 
349 aa  418  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  44.71 
 
 
351 aa  302  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  45.73 
 
 
343 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  44.88 
 
 
343 aa  299  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  44.82 
 
 
343 aa  298  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  44.82 
 
 
343 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  45.12 
 
 
343 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  45.12 
 
 
343 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  50.32 
 
 
328 aa  296  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  45.12 
 
 
343 aa  295  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  44.94 
 
 
358 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  46.43 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  46.43 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  46.43 
 
 
319 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  44.69 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  40.84 
 
 
356 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  34.68 
 
 
317 aa  179  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  35.69 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  28.33 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  28.61 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  30.48 
 
 
333 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  27.92 
 
 
361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  25.96 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  25.36 
 
 
368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  25.39 
 
 
368 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  23.2 
 
 
368 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  24.92 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  26.95 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  26.77 
 
 
376 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.45 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  28.57 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  26.96 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  25.84 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  26.64 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  27.13 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  26.58 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.97 
 
 
352 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  25.9 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.3 
 
 
410 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  26.36 
 
 
495 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.16 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.17 
 
 
351 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  23.13 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  23.13 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  27.21 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  27.21 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.46 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.21 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  27.06 
 
 
424 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  27.21 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  24.75 
 
 
349 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  43.4 
 
 
357 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  28.05 
 
 
454 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  23.34 
 
 
362 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.81 
 
 
350 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  24.56 
 
 
387 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  30.28 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  24 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  23.63 
 
 
352 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  22.22 
 
 
448 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  23.69 
 
 
388 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  30.48 
 
 
435 aa  49.3  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  26.74 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  23.19 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  27.33 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  37.04 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  37.04 
 
 
405 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.36 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25.97 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4056  fatty acid desaturase  33.64 
 
 
347 aa  46.2  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.403518  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  27.41 
 
 
286 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3606  fatty acid desaturase  30.6 
 
 
357 aa  46.2  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  35.85 
 
 
394 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  27.54 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  40.91 
 
 
180 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  23.51 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  31.25 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  24.55 
 
 
363 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  23.9 
 
 
435 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>