More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0836 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  91.77 
 
 		 401 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 401 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  57.95 
 
 		 420 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  54.23 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 		 396 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  37.14 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  38.58 
 
 		 425 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.63 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  39.11 
 
 		 424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.11 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 		 391 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  35.84 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 399 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  34.89 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.31 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  36.53 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  34.49 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.49 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 464 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.15 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 517 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 		 400 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  28.61 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  29.04 
 
 		 405 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 		 424 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  29.29 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  40.38 
 
 		 367 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  28.17 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  27.25 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  26.49 
 
 		 494 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 		 607 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.97 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.39 
 
 		 483 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  30.39 
 
 		 483 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 632 aa  97.1  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25.6 
 
 		 584 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25.36 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  31.9 
 
 		 483 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 741 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.16 
 
 		 585 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  28.03 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.67 
 
 		 645 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 859 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 		 546 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  26.28 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 		 861 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 		 699 aa  91.7  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.37 
 
 		 764 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.7 
 
 		 500 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.82 
 
 		 656 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  35.44 
 
 		 729 aa  90.1  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.72 
 
 		 858 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 860 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.31 
 
 		 672 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 		 586 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  27.56 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.71 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.04 
 
 		 757 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.94 
 
 		 864 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.75 
 
 		 911 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.69 
 
 		 638 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  32.46 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  32.46 
 
 		 437 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 681 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.91 
 
 		 662 aa  87  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  26.61 
 
 		 441 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.52 
 
 		 614 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32 
 
 		 652 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.03 
 
 		 725 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 		 641 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 		 756 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  38.06 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.02 
 
 		 528 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  25.81 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  31.35 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  27.75 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.28 
 
 		 1207 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  26.5 
 
 		 903 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  34.08 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.34 
 
 		 744 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 		 752 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  34.24 
 
 		 797 aa  82.8  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.56 
 
 		 701 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.56 
 
 		 643 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>