280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0803 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0915  ATP-dependent DNA ligase  95.75 
 
 		 541 aa  1043    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137062  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6007  ATP-dependent DNA ligase  75.88 
 
 		 539 aa  835    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0032  ATP-dependent DNA ligase  63.4 
 
 		 536 aa  673    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2804  ATP-dependent DNA ligase  70.71 
 
 		 537 aa  771    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414276  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0803  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 541 aa  1085    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.117454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4044  ATP-dependent DNA ligase  62.78 
 
 		 539 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4898  ATP-dependent DNA ligase  57.59 
 
 		 539 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1470  ATP dependent DNA ligase  56.02 
 
 		 542 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1541  ATP dependent DNA ligase  54.46 
 
 		 570 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0412  ATP dependent DNA ligase  56.9 
 
 		 514 aa  574  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.900501  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3432  ATP dependent DNA ligase  53.13 
 
 		 576 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0304262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3691  ATP dependent DNA ligase  52.89 
 
 		 572 aa  567  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0628  ATP dependent DNA ligase  53.58 
 
 		 568 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.639244  decreased coverage  0.00714589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3237  ATP dependent DNA ligase  50 
 
 		 613 aa  550  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.330095  normal  0.222492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0462  ATP-dependent DNA ligase  50.25 
 
 		 594 aa  547  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0751  ATP-dependent DNA ligase  52.82 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.280099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3561  ATP dependent DNA ligase  49.41 
 
 		 614 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147448 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0553  ATP-dependent DNA ligase  54.14 
 
 		 561 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1071  ATP dependent DNA ligase  51.15 
 
 		 574 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.088062 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0068  ATP-dependent DNA ligase  53.8 
 
 		 531 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0290  ATP-dependent DNA ligase  50 
 
 		 550 aa  514  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3979  ATP-dependent DNA ligase  52.29 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.379965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1611  ATP dependent DNA ligase  50.66 
 
 		 522 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0870  ATP-dependent DNA ligase  54.75 
 
 		 622 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.140434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0798  ATP-dependent DNA ligase  55.33 
 
 		 648 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109452  normal  0.0163574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4617  ATP-dependent DNA ligase  55.97 
 
 		 622 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0793  ATP-dependent DNA ligase  52.75 
 
 		 630 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.758441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00668  DNA ligase  41.23 
 
 		 576 aa  430  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.60466  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3895  ATP-dependent DNA ligase  39.22 
 
 		 551 aa  337  5e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2562  ATP dependent DNA ligase  37.66 
 
 		 535 aa  329  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2960  ATP-dependent DNA ligase  40.44 
 
 		 535 aa  326  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6857  ATP dependent DNA ligase  37.57 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.924337  normal  0.118478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2195  ATP-dependent DNA ligase  38.61 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0151417  hitchhiker  0.0044454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2589  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 534 aa  320  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00328254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1569  ATP-dependent DNA ligase  40.07 
 
 		 532 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0306  ATP-dependent DNA ligase  38.1 
 
 		 559 aa  317  4e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247281  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2413  ATP-dependent DNA ligase  39.6 
 
 		 533 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1105  ATP-dependent DNA ligase  38.49 
 
 		 552 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.660067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02270  DNA ligase  37.87 
 
 		 530 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01736  ATP-dependent DNA ligase  38.41 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1076  ATP-dependent DNA ligase  39.6 
 
 		 533 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3135  ATP dependent DNA ligase  35.7 
 
 		 584 aa  313  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.519108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3334  ATP dependent DNA ligase  37.39 
 
 		 532 aa  313  6.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1145  ATP-dependent DNA ligase  38.31 
 
 		 552 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.646236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5292  ATP-dependent DNA ligase  38.41 
 
 		 558 aa  312  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0311  ATP-dependent DNA ligase  37.63 
 
 		 559 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2667  ATP-dependent DNA ligase  39.78 
 
 		 532 aa  311  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.256758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4307  ATP-dependent DNA ligase  37.68 
 
 		 552 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.66248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0375  ATP-dependent DNA ligase  37.21 
 
 		 566 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1315  ATP-dependent DNA ligase  38.05 
 
 		 558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693977  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1134  ATP-dependent DNA ligase  37.61 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.720613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1518  ATP-dependent DNA ligase  39.61 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.111157  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4859  ATP-dependent DNA ligase  37.28 
 
 		 551 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3044  ATP-dependent DNA ligase  37.92 
 
 		 563 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0164872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1755  ATP dependent DNA ligase  36.07 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4680  ATP-dependent DNA ligase  38.27 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.137791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1583  ATP dependent DNA ligase  38.13 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3873  ATP-dependent DNA ligase  36.17 
 
 		 567 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.537943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4135  DNA ligase, ATP-dependent  36.1 
 
 		 571 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3524  ATP-dependent DNA ligase  36.17 
 
 		 538 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.755693 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1211  ATP-dependent DNA ligase  35.83 
 
 		 562 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3449  ATP dependent DNA ligase  36.15 
 
 		 544 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.422145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1040  ATP-dependent DNA ligase  34.66 
 
 		 554 aa  280  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.081093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1462  ATP-dependent DNA ligase  33.87 
 
 		 551 aa  272  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0685513 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08591  ATP-dependent DNA ligase  32.31 
 
 		 545 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.267229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07831  ATP-dependent DNA ligase  30.62 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0733  ATP-dependent DNA ligase  31.23 
 
 		 546 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07831  ATP-dependent DNA ligase  30.62 
 
 		 546 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.555428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4475  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.17 
 
 		 576 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  35.22 
 
 		 1017 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1088  DNA ligase I, ATP-dependent (dnl1)  29.14 
 
 		 567 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1425  ATP-dependent DNA ligase  32.72 
 
 		 527 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.272318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1899  DNA ligase (ATP)  27.67 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.812103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2723  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.43 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.663376 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0864  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.36 
 
 		 562 aa  125  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0735643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0427  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30 
 
 		 531 aa  123  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1865  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.38 
 
 		 548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3810  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.62 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1037  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  25.35 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4301  ATP-dependent DNA ligase  30.41 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2156  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  26.1 
 
 		 550 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.521071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0933  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  31.32 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399541  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  30.57 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0068  ATP-dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 584 aa  118  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00333872  normal  0.197829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1898  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.88 
 
 		 592 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  30.89 
 
 		 513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0844  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  27.61 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357397  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4316  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375111  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0878  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.75 
 
 		 594 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0334376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2438  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.11 
 
 		 509 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.126191  normal  0.0460021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1115  ATP-dependent DNA ligase  26.6 
 
 		 584 aa  113  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.41546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0076  ATP-dependent DNA ligase  26.35 
 
 		 584 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.101904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1124  ATP-dependent DNA ligase  26.76 
 
 		 603 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000816424  normal  0.578001 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0620  hypothetical protein  27.16 
 
 		 546 aa  110  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0814  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  28.27 
 
 		 590 aa  110  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.389607  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2344  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.69 
 
 		 510 aa  110  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.873695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13079  ATP-dependent DNA ligase  32.17 
 
 		 507 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4312  ATP-dependent DNA ligase  29.28 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7176  ATP-dependent DNA ligase  30.14 
 
 		 508 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2642  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  29.83 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>