More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0671 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0671  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461585  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  84 
 
 
303 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0552  beta-lactamase domain-containing protein  69.77 
 
 
302 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_004310  BR0505  metallo-beta-lactamase family protein  63.39 
 
 
301 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  63.27 
 
 
316 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0508  metallo-beta-lactamase family protein  63.39 
 
 
306 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  63.05 
 
 
302 aa  384  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2470  beta-lactamase domain-containing protein  57.14 
 
 
305 aa  332  6e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.64 
 
 
285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2901  beta-lactamase domain-containing protein  56.38 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605946  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3127  beta-lactamase domain protein  56.04 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2452  putative Beta-lactamase  52.82 
 
 
304 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4394  beta-lactamase domain protein  55.85 
 
 
304 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3024  beta-lactamase domain protein  55.03 
 
 
310 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0101087  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1265  beta-lactamase-like  53.04 
 
 
310 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.581191  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2731  beta-lactamase domain-containing protein  56.19 
 
 
307 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1163  Beta-lactamase-like  52.36 
 
 
310 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0506017  normal  0.1623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  51.99 
 
 
310 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0613  beta-lactamase-like  52 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4296  beta-lactamase-like  52.86 
 
 
308 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.0768999 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0754  beta-lactamase-like  52.54 
 
 
315 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  48.14 
 
 
301 aa  285  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  53.74 
 
 
317 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  49.83 
 
 
302 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0953  beta-lactamase domain-containing protein  48.11 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0859  beta-lactamase domain-containing protein  48.18 
 
 
304 aa  265  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1316  beta-lactamase domain-containing protein  45.82 
 
 
297 aa  258  8e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.078247  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0361  beta-lactamase-like protein  47.87 
 
 
306 aa  246  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  46.94 
 
 
313 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4714  beta-lactamase domain-containing protein  47.16 
 
 
312 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644544  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  43.24 
 
 
307 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0086  beta-lactamase-like  46.35 
 
 
311 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1837  beta-lactamase domain-containing protein  45.42 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  45.42 
 
 
303 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2717  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 
278 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  44.12 
 
 
288 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1832  beta-lactamase-like  44.96 
 
 
294 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930975  normal  0.178967 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 
282 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1920  hypothetical protein  37.46 
 
 
301 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000181581  hitchhiker  0.000000000000329346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1452  beta-lactamase domain-containing protein  43.42 
 
 
556 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463729  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4249  NUDIX hydrolase:Beta-lactamase-like  38.65 
 
 
566 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1644  beta-lactamase-like protein  39.71 
 
 
566 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162683  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3801  beta-lactamase domain-containing protein  37.63 
 
 
545 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3441  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
544 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0793  beta-lactamase domain-containing protein  38.43 
 
 
556 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541294  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 
568 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  38.16 
 
 
568 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1055  beta-lactamase-like  36.75 
 
 
550 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0874  beta-lactamase domain protein  37.98 
 
 
557 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1888  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 
559 aa  148  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3446  beta-lactamase-like  36.4 
 
 
562 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0116  putative hydrolase  33.09 
 
 
284 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1541  beta-lactamase domain protein  36.98 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13708  hydrolase  33.45 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0451158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  34.88 
 
 
262 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4749  beta-lactamase domain protein  34.93 
 
 
288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5314  beta-lactamase domain protein  32.59 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8910  beta-lactamase domain protein  33.58 
 
 
264 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5206  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
259 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1370  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 
257 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.157662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4819  beta-lactamase-like protein  31.05 
 
 
259 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4905  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
259 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2528  beta-lactamase domain-containing protein  34.72 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00565773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5436  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1997  beta-lactamase domain-containing protein  31.85 
 
 
268 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  31.11 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0504  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
267 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0630883  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2265  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
275 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000365974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0248  beta-lactamase domain protein  33.8 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1854  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 
272 aa  115  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4788  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0330  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
259 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478372  normal  0.100644 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25410  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.75 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3933  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
276 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.997989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3208  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
258 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.229767  normal  0.168477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1063  beta-lactamase domain-containing protein  29.59 
 
 
255 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4347  beta-lactamase domain-containing protein  32.7 
 
 
275 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0338  beta-lactamase domain-containing protein  32.36 
 
 
255 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0716  beta-lactamase domain protein  32.21 
 
 
270 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  29.45 
 
 
286 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0512  beta-lactamase domain protein  29.97 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19280  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.74 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  26.99 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  26.99 
 
 
285 aa  92.4  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2833  beta-lactamase domain protein  27.49 
 
 
277 aa  92  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.705023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0425  beta-lactamase domain protein  31.07 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0641  beta-lactamase domain protein  29.71 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.117018  normal  0.604387 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1303  beta-lactamase domain protein  28.17 
 
 
262 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4284  beta-lactamase-like  30.62 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36150  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.79 
 
 
258 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1276  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0675547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 
497 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26240  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.88 
 
 
273 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.810697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 
497 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  31.85 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07070  conserved hypothetical protein  27.73 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0787298 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00149  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14570)  26.85 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06001  metallo-beta-lactamase domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G00120)  27.68 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.355889  normal  0.401572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>