More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0572 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  93.52 
 
 		 216 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  85.19 
 
 		 216 aa  377  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 226 aa  239  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 251 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  57.77 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  54.72 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  54.72 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  52.43 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  55.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  53.88 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  55.66 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 218 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  49.5 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  48.04 
 
 		 230 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  46.04 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  43.46 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  43.72 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  43.72 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  44.72 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  41.45 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  48.54 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  42 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  40.38 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 214 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 226 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  41.28 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 233 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 222 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  36.92 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  36.55 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 241 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  35.53 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.55 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>