132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0525 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  100 
 
 
258 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  93.25 
 
 
256 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  70.82 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  68.2 
 
 
242 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  54.8 
 
 
263 aa  248  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  57.66 
 
 
264 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  57.14 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  57.14 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  55.16 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  38.43 
 
 
250 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  38.82 
 
 
250 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  39.68 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  39.57 
 
 
252 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  43.04 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  44.3 
 
 
288 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  35.78 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  41.63 
 
 
256 aa  125  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  41.05 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  40 
 
 
257 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  44.3 
 
 
261 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  38.06 
 
 
259 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  43.83 
 
 
253 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  40.95 
 
 
250 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  32.14 
 
 
262 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  38.08 
 
 
257 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  33.62 
 
 
252 aa  105  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  36.86 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  33.61 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  31.82 
 
 
253 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  31.82 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  35.6 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  29.27 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  30.8 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  26.72 
 
 
251 aa  86.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  25.43 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  29.91 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  35.86 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  29.86 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  28.27 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  31.54 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  28.63 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  24.89 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  27.8 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  28.93 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  37 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  26.61 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  29.96 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.63 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  25 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  26.96 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  27.64 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.66 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  22.17 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  28.38 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  23.11 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  25.31 
 
 
258 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.3 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  24.89 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  28.99 
 
 
211 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  26.24 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  27.19 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.3 
 
 
338 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  24.57 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  23.5 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  24.07 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  23.79 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  28 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  20.93 
 
 
233 aa  55.5  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  25.58 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  25.31 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  24.54 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  21.4 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  27.49 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  25.61 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  21.1 
 
 
233 aa  52  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  25.61 
 
 
238 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.41 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  24.02 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  21.76 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  20.28 
 
 
233 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  25.2 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  25.2 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  23.47 
 
 
216 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  28.92 
 
 
335 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.27 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  21.76 
 
 
246 aa  48.9  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2496  hypothetical protein  24.84 
 
 
488 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  26.67 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  21.3 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1571  hypothetical protein  24.14 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  21.08 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  23.73 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  21.3 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  21.3 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  21.3 
 
 
246 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>