More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0431 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
330 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  85.76 
 
 
330 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  60.98 
 
 
326 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  68.07 
 
 
293 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
331 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  43.88 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  50.71 
 
 
309 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  50.71 
 
 
307 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
306 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  47.16 
 
 
305 aa  256  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3347  twin-arginine translocation pathway signal  44.96 
 
 
311 aa  246  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  44.29 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  43.17 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  37.89 
 
 
315 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  37.99 
 
 
304 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 
330 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  34.58 
 
 
329 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  34.04 
 
 
321 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  38.87 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4469  hypothetical protein  35.29 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.871695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  34.26 
 
 
329 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  37.11 
 
 
314 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  34.02 
 
 
329 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
327 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  34.75 
 
 
322 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  34.15 
 
 
329 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  33.9 
 
 
329 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  33.22 
 
 
327 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5326  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 
315 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.524715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
326 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  31.94 
 
 
336 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
324 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  35.23 
 
 
327 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
311 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  32.99 
 
 
322 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
327 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  33.91 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4163  beta-lactamase domain protein  34.98 
 
 
316 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 
324 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  34.49 
 
 
339 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
334 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  31.94 
 
 
330 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 
324 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  30.19 
 
 
321 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  31.14 
 
 
351 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  33.33 
 
 
339 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  31.53 
 
 
342 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  34.12 
 
 
336 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  33.11 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  32.64 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
332 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 
326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.33 
 
 
277 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  33.6 
 
 
300 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
293 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  33.22 
 
 
293 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 
291 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 
322 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  33.57 
 
 
293 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2909  hypothetical protein  29.25 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  31.25 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  30.88 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  30.93 
 
 
320 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  30.71 
 
 
277 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  33.08 
 
 
282 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  32.4 
 
 
313 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  31.41 
 
 
318 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  32.06 
 
 
329 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
315 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
310 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
310 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 
311 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  30.24 
 
 
311 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  29.01 
 
 
305 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  29.62 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  29.62 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  29.41 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  34.82 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
319 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  30.23 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  30.04 
 
 
279 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 
302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  28.87 
 
 
310 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
310 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 
279 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  29.82 
 
 
292 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.91 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.93 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  30.5 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  30.63 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  31.82 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>