More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0290 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.23 
 
 
845 aa  1030  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.13 
 
 
856 aa  701  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  71.22 
 
 
839 aa  1184  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  95.05 
 
 
848 aa  1592  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.55 
 
 
856 aa  695  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62 
 
 
844 aa  1023  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  56.08 
 
 
834 aa  933  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  58 
 
 
844 aa  920  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
849 aa  1691  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  44.06 
 
 
843 aa  679  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  50.24 
 
 
853 aa  781  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  61.45 
 
 
844 aa  1031  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.06 
 
 
846 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.44 
 
 
846 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  50.39 
 
 
535 aa  486  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.53 
 
 
858 aa  481  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  48.51 
 
 
535 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  49.02 
 
 
533 aa  466  1e-130  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  46.3 
 
 
532 aa  458  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  47.33 
 
 
533 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  49.2 
 
 
533 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.51 
 
 
759 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  46.36 
 
 
532 aa  455  1e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  48.4 
 
 
533 aa  455  1e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  46.55 
 
 
533 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.33 
 
 
785 aa  452  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.33 
 
 
785 aa  452  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  45.61 
 
 
534 aa  446  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  44.63 
 
 
531 aa  439  1e-122  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  46.05 
 
 
534 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  45.37 
 
 
533 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  45.07 
 
 
534 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  46.17 
 
 
532 aa  432  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  46.85 
 
 
534 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  46.17 
 
 
532 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  45.27 
 
 
554 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  42.6 
 
 
554 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  43.99 
 
 
554 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.63 
 
 
762 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  45.47 
 
 
556 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  47.18 
 
 
554 aa  409  1e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  41.89 
 
 
531 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  34.75 
 
 
735 aa  401  1e-110  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  43.36 
 
 
537 aa  401  1e-110  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  47.08 
 
 
554 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  47.08 
 
 
554 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  40.45 
 
 
532 aa  387  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  41.75 
 
 
535 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.71 
 
 
759 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  43.15 
 
 
533 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.13 
 
 
761 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.27 
 
 
740 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.52 
 
 
525 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 
530 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  40.23 
 
 
501 aa  369  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  39.34 
 
 
551 aa  363  9e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.48 
 
 
532 aa  362  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.25 
 
 
532 aa  360  7e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 
533 aa  359  1e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.96 
 
 
530 aa  359  1e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  39.3 
 
 
505 aa  354  3e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 
533 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  32.86 
 
 
849 aa  352  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 
508 aa  352  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.18 
 
 
995 aa  350  6e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  39.96 
 
 
632 aa  342  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.93 
 
 
524 aa  341  3e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  40.49 
 
 
530 aa  341  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  34.9 
 
 
748 aa  340  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  41.35 
 
 
532 aa  340  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.93 
 
 
1055 aa  339  2e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  40.26 
 
 
526 aa  337  6e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.63 
 
 
756 aa  334  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.58 
 
 
594 aa  333  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.58 
 
 
594 aa  333  8e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.66 
 
 
533 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  40.15 
 
 
625 aa  333  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  41.21 
 
 
533 aa  333  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  39.88 
 
 
629 aa  332  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 
626 aa  330  5e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
632 aa  329  1e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 
632 aa  328  2e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  39.85 
 
 
621 aa  328  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 
636 aa  327  4e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  39.49 
 
 
629 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  41.21 
 
 
604 aa  325  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  40.36 
 
 
681 aa  324  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  38.82 
 
 
640 aa  321  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.03 
 
 
534 aa  321  4e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.5 
 
 
991 aa  321  4e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.36 
 
 
996 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  40.42 
 
 
532 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  37.96 
 
 
621 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.05 
 
 
533 aa  318  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0701  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 
687 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  33.23 
 
 
989 aa  317  8e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  38.89 
 
 
621 aa  315  2e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  38.99 
 
 
626 aa  314  4e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.78 
 
 
995 aa  314  4e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  32.94 
 
 
1029 aa  313  7e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>