More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0260 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  100 
 
 
404 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  89.6 
 
 
404 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.15 
 
 
448 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.52 
 
 
403 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.39 
 
 
397 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.02 
 
 
416 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.36 
 
 
398 aa  122  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  29.12 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.8 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.72 
 
 
473 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  29.57 
 
 
391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.94 
 
 
381 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.61 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.7 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.89 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.21 
 
 
401 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.76 
 
 
386 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.52 
 
 
418 aa  113  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.39 
 
 
417 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  32.06 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.42 
 
 
391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.04 
 
 
409 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.68 
 
 
417 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.02 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.17 
 
 
393 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.88 
 
 
408 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  29.43 
 
 
395 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  30.03 
 
 
413 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.89 
 
 
395 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  28.57 
 
 
436 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.41 
 
 
393 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.75 
 
 
417 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.75 
 
 
396 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.8 
 
 
390 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  26.39 
 
 
396 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.89 
 
 
400 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  28.9 
 
 
392 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.5 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.07 
 
 
396 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.12 
 
 
399 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.15 
 
 
401 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.85 
 
 
410 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.14 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  30.12 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  27.34 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  29.86 
 
 
420 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.96 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.7 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  26.92 
 
 
363 aa  96.7  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  22.96 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.85 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  28.39 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.81 
 
 
389 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.46 
 
 
400 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  30.48 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.2 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.41 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.32 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.26 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.68 
 
 
400 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.11 
 
 
400 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.12 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  26.76 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.78 
 
 
396 aa  93.6  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  29.29 
 
 
382 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  27.78 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.15 
 
 
389 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.54 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.9 
 
 
405 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.45 
 
 
399 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  32.99 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.14 
 
 
404 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  27.76 
 
 
410 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.81 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  30.61 
 
 
374 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  27.78 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.36 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.75 
 
 
435 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  26.59 
 
 
410 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  26.55 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.16 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  27.05 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  25.87 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  30.92 
 
 
434 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  30.35 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  25.88 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  30.46 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  26.17 
 
 
409 aa  89.4  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.13 
 
 
428 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.56 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  30.05 
 
 
438 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.25 
 
 
400 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  29.6 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.36 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.74 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  32.68 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.36 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.88 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.12 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  30.43 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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