199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0258 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  95.81 
 
 		 477 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 477 aa  971    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  69.38 
 
 		 484 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  64.54 
 
 		 536 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.105917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4098  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 569 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00991271  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  25.67 
 
 		 558 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  25.31 
 
 		 574 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2663  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 574 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 451 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  23.26 
 
 		 579 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1321  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 574 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00160153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1597  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 573 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.71 
 
 		 573 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1918  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.46 
 
 		 573 aa  95.1  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 588 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.73 
 
 		 574 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 579 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 579 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 610 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 593 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.94 
 
 		 574 aa  90.5  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 580 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 572 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 574 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  22.91 
 
 		 579 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.57 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  23.62 
 
 		 580 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 579 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 580 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  22.84 
 
 		 596 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  24.59 
 
 		 578 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  24.44 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  24.17 
 
 		 580 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 595 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 598 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.4 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  24.16 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  24.33 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.98 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 577 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 580 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 467 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 467 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 579 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 580 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 577 aa  76.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 579 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  24.35 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 577 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 599 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.5 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.5 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2566  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 580 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.9 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 577 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>