283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0199 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
153 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  95.42 
 
 
153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  77.12 
 
 
153 aa  253  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.87 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  54.79 
 
 
154 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.23 
 
 
163 aa  170  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.01 
 
 
152 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  51.37 
 
 
159 aa  167  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  57.24 
 
 
155 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  50.65 
 
 
154 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.52 
 
 
163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  52.45 
 
 
157 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.82 
 
 
163 aa  163  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.77 
 
 
146 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.3 
 
 
154 aa  158  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  50.71 
 
 
145 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  48.94 
 
 
145 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  155  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.59 
 
 
162 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.06 
 
 
145 aa  153  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.94 
 
 
145 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  51.06 
 
 
149 aa  153  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 
153 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.35 
 
 
145 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.81 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.68 
 
 
145 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 
143 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.39 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  48.85 
 
 
157 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.23 
 
 
159 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  48.23 
 
 
159 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
145 aa  148  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
145 aa  147  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.52 
 
 
145 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  45.45 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.97 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.48 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  46.15 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.68 
 
 
145 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.26 
 
 
146 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  47.83 
 
 
167 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  43.26 
 
 
145 aa  141  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
145 aa  140  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  45.14 
 
 
158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  42.57 
 
 
157 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.43 
 
 
151 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
157 aa  135  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  51.06 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.96 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  50.7 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
159 aa  130  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
159 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
158 aa  130  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.56 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.85 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
149 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
159 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  45.59 
 
 
156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.62 
 
 
151 aa  127  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  45.71 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 
156 aa  126  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.26 
 
 
283 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  39.22 
 
 
151 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
149 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
152 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.62 
 
 
152 aa  124  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  39.72 
 
 
143 aa  123  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
149 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
152 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.51 
 
 
165 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.62 
 
 
159 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.45 
 
 
146 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.68 
 
 
143 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.51 
 
 
165 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>