80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0197 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  100 
 
 
310 aa  613  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  86.17 
 
 
311 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  64.74 
 
 
338 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  60.19 
 
 
326 aa  345  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  49.01 
 
 
324 aa  236  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  39.42 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  38.89 
 
 
329 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  37.99 
 
 
303 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  39.01 
 
 
331 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  38.7 
 
 
331 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  38.36 
 
 
308 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  35.23 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  39.61 
 
 
311 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  35.41 
 
 
255 aa  151  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 
308 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.47 
 
 
276 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  37.69 
 
 
315 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  40.52 
 
 
312 aa  138  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  40.65 
 
 
330 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.57 
 
 
561 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.57 
 
 
561 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  34.64 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  36.3 
 
 
436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  36.46 
 
 
274 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  36.33 
 
 
241 aa  122  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  33.2 
 
 
447 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 
272 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  36.23 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.72 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.07 
 
 
577 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.57 
 
 
436 aa  106  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  31.89 
 
 
456 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  28.53 
 
 
439 aa  95.5  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.72 
 
 
436 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  27.02 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  32.82 
 
 
256 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  27.94 
 
 
200 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  34.02 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 
232 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
256 aa  49.7  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.28 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  23.33 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  26.67 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  27.59 
 
 
251 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  23 
 
 
210 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 
221 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 
3145 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  25.83 
 
 
251 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
1314 aa  46.2  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  25.83 
 
 
251 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  25.83 
 
 
251 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  27.52 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
244 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  21.4 
 
 
358 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  33.83 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 
356 aa  44.7  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  28.49 
 
 
191 aa  43.9  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 
251 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  25 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1392  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
204 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
1312 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  28.68 
 
 
210 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 
243 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
1121 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0744  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 
164 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  24.63 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  25.86 
 
 
251 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 
202 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 
201 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
215 aa  42.4  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  37.1 
 
 
564 aa  42.4  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>