More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0172 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  97.89 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  82.28 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  83.12 
 
 		 235 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  68.53 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  68.53 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  68.53 
 
 		 240 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  64.53 
 
 		 242 aa  321  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  59.23 
 
 		 240 aa  287  8e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  60.62 
 
 		 242 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  57.96 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  59.73 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  57.52 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.52 
 
 		 237 aa  278  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  58.33 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  56.84 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  58.15 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  57.71 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  56.83 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  57.27 
 
 		 238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  57.02 
 
 		 240 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  56.39 
 
 		 238 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  55.13 
 
 		 239 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  55.16 
 
 		 234 aa  256  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  52.52 
 
 		 243 aa  245  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  53.15 
 
 		 236 aa  234  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  51.95 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  48.07 
 
 		 243 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  45.99 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  45.69 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  45.64 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  44.84 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.8 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  43.97 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  43.4 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.86 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  44.64 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  46.88 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  41.35 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  42.79 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  42.79 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  42.08 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  44.34 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  41.63 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  41.05 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  40.79 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  40.19 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 229 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  37.21 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.96 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 227 aa  148  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  39.09 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  37.9 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.73 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.98 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.38 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  37.1 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  35.51 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  37.09 
 
 		 232 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  35.98 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  35.98 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  35.98 
 
 		 240 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  36.99 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.85 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  35.51 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.37 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 234 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.85 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  38.25 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 216 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 		 234 aa  141  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  35.51 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  38.99 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>