177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0140 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  48.9 
 
 
799 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  50.42 
 
 
840 aa  798    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  50.12 
 
 
812 aa  760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  50 
 
 
824 aa  786    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  42.39 
 
 
880 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  47.16 
 
 
846 aa  745    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  87.15 
 
 
817 aa  1503    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  44.7 
 
 
843 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  48.78 
 
 
829 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  47.76 
 
 
831 aa  727    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
818 aa  1682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  44.47 
 
 
843 aa  633  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  38.12 
 
 
813 aa  456  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  33.57 
 
 
845 aa  426  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  33.05 
 
 
864 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.58 
 
 
845 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  39.38 
 
 
819 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  32.82 
 
 
875 aa  401  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  37.05 
 
 
839 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  36.46 
 
 
833 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.46 
 
 
860 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  33.08 
 
 
786 aa  394  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.95 
 
 
835 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 
793 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.43 
 
 
813 aa  389  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 
785 aa  389  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  36.04 
 
 
897 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  34.85 
 
 
823 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.09 
 
 
872 aa  379  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.91 
 
 
842 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  34.21 
 
 
837 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 
863 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 
871 aa  361  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  34.43 
 
 
819 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  34.6 
 
 
819 aa  352  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  30.17 
 
 
891 aa  343  7e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  33.65 
 
 
815 aa  342  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  30.21 
 
 
802 aa  340  4e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  32.34 
 
 
861 aa  340  7e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  29.9 
 
 
891 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  31.83 
 
 
802 aa  337  7.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  33.44 
 
 
847 aa  332  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  31.93 
 
 
824 aa  322  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.23 
 
 
837 aa  321  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  33.33 
 
 
838 aa  311  2.9999999999999997e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  28.33 
 
 
940 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  34.03 
 
 
663 aa  214  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.89 
 
 
845 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 
763 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 
826 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.54 
 
 
826 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  28.18 
 
 
882 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.48 
 
 
878 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  26.4 
 
 
882 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  24.74 
 
 
820 aa  154  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  27.55 
 
 
839 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  27.55 
 
 
839 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  27.55 
 
 
839 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  27.55 
 
 
839 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  27.55 
 
 
839 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  27.55 
 
 
839 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  27.55 
 
 
839 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  28.06 
 
 
839 aa  147  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  28.21 
 
 
962 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  28.57 
 
 
816 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.38 
 
 
734 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  24.65 
 
 
816 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  27.45 
 
 
828 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  27.45 
 
 
828 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  27.45 
 
 
828 aa  135  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  27.07 
 
 
811 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  23.61 
 
 
821 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.79 
 
 
744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  24.3 
 
 
1144 aa  128  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  25.74 
 
 
825 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  24.13 
 
 
856 aa  122  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  25.92 
 
 
827 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  24.68 
 
 
853 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  25.59 
 
 
812 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.59 
 
 
971 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.02 
 
 
984 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 
739 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 
724 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  27.38 
 
 
815 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.29 
 
 
720 aa  91.3  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.09 
 
 
1243 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.73 
 
 
757 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.2 
 
 
799 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.41 
 
 
858 aa  82  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  23.52 
 
 
906 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.65 
 
 
901 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.99 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.79 
 
 
609 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  21.06 
 
 
803 aa  72  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  25.83 
 
 
575 aa  70.1  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.1 
 
 
1362 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.12 
 
 
905 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.8 
 
 
800 aa  65.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.28 
 
 
884 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.77 
 
 
717 aa  65.1  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>