More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0133 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  86.57 
 
 		 217 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 220 aa  174  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  45.23 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 207 aa  95.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5222  transcriptional regulator  28.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  28.3 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.84 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  25.96 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  34.21 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  38.98 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  36.49 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  38.98 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  42.11 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>