More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0075 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  90.5 
 
 
358 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
358 aa  728    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9026  sensory transduction histidine kinase  75 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  48.99 
 
 
356 aa  328  8e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  47.99 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3516  signal transduction histidine kinase  45.32 
 
 
368 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.135584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2439  signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 
366 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0424622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2265  signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 
365 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.887672  normal  0.277402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3015  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  43.85 
 
 
366 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
878 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
839 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
1093 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
1093 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
347 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2946  signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
349 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.341682  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
1253 aa  122  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
488 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  33.8 
 
 
783 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
964 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
526 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
382 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
551 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
1714 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
681 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
472 aa  116  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
1390 aa  116  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
941 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
991 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  33.82 
 
 
1668 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
1654 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
1560 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
2693 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3762  signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
215 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
932 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
813 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
788 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.28 
 
 
1239 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
674 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  25.71 
 
 
754 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  33.33 
 
 
744 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
613 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
1227 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
872 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 
732 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
1246 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3280  PAS sensor protein  28.25 
 
 
354 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1135  putative signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 
338 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.177976  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
272 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.43 
 
 
1663 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
924 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
572 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
945 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
600 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
815 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  27.91 
 
 
886 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
771 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
693 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
764 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
856 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 
1051 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
771 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3604  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
354 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  29.19 
 
 
1248 aa  102  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
437 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0772  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
371 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2184  hypothetical protein  27.57 
 
 
676 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.677561  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.36 
 
 
1047 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  23.85 
 
 
1210 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
909 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
547 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
354 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 
1177 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2594  hypothetical protein  28.64 
 
 
657 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0722689  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0298  signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
294 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.926614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  28.06 
 
 
391 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
756 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
408 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  24.76 
 
 
892 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
913 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
648 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
3706 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 
832 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
727 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 
1676 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
739 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  24.89 
 
 
682 aa  97.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
790 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
980 aa  97.1  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  26.79 
 
 
945 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
545 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  25.36 
 
 
1182 aa  96.3  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
657 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
400 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  29.84 
 
 
1289 aa  95.9  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1343  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
350 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.54395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>