262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0063 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  95.83 
 
 		 288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  78.6 
 
 		 292 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  77.19 
 
 		 299 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  69.63 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  68.15 
 
 		 279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  68.15 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  71.85 
 
 		 283 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  62.65 
 
 		 272 aa  358  7e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  64.58 
 
 		 285 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  62.13 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  63.77 
 
 		 274 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  62.78 
 
 		 284 aa  341  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  62.64 
 
 		 268 aa  338  7e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  63.16 
 
 		 279 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  64.29 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  56.32 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  56.02 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.46 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  52.78 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  53.02 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  55.43 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.08 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  54.76 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  49.32 
 
 		 287 aa  279  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  54.72 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  54.72 
 
 		 287 aa  278  9e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  50.75 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  51.78 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  46.49 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  51.57 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  49.25 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  48.73 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  46.98 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  51.79 
 
 		 289 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  45.76 
 
 		 270 aa  248  9e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  46.72 
 
 		 288 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  46.72 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  47.39 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  43.93 
 
 		 282 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  48.44 
 
 		 273 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.59 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.44 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  47.71 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  49 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  45.56 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  48.62 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  45.69 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  43.68 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  47.25 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  48.84 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  48.84 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  48.84 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  48.45 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  48.45 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  48.45 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  42.29 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  41.53 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  42.86 
 
 		 271 aa  202  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  43.57 
 
 		 251 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.11 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  52.41 
 
 		 175 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  56.2 
 
 		 147 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  46.67 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  39.22 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.13 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  37.59 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  48.34 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.29 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.26 
 
 		 229 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  37.11 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  47.68 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.86 
 
 		 245 aa  147  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  36.68 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  39.51 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  39.06 
 
 		 269 aa  145  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  36.78 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  41.44 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  37.93 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  37.18 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  41.47 
 
 		 242 aa  143  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  42.35 
 
 		 247 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  34.02 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  40.88 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  48.68 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  40.88 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  35.14 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  38.03 
 
 		 267 aa  142  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  44.37 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  36.82 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  34.75 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  44.37 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  40.56 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  46.36 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  39.66 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>