175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0057 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0057  PilT protein domain protein  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0074  PilT protein domain protein  51.77 
 
 		 139 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  41.84 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  38.13 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  40.29 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0805  PilT protein-like  42.75 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4575  PilT protein-like  39.13 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3575  PilT protein domain protein  39.44 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00704853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1070  PilT protein-like protein  38.69 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  39.72 
 
 		 151 aa  90.1  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23550  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain protein  39.86 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.46968  normal  0.640927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0630  PilT protein domain protein  39.13 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  39.13 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1876  plasmid stabilization protein StbB-like  40 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.417395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2640  PilT domain-containing protein  38.57 
 
 		 139 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4764  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.310304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4619  PilT domain-containing protein  34.04 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0018  plasmid stability protein StbB  35.51 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0242004  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  32.14 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0076  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  32.14 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2795  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.517688  normal  0.128803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3767  PilT domain-containing protein  35.92 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.546918  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5841  PilT domain-containing protein  37.41 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4019  PilT protein-like  35.71 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2302  plasmid stabilization protein  31.88 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.171886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  35.29 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1964  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  33.82 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  35 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5262  PilT protein domain protein  34.29 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0679342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4188  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.990127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  36.11 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3889  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3474  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3027  PilT protein domain protein  32.61 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4210  PilT domain-containing protein  39.42 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.242184  normal  0.98897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0896  PilT protein-like  32.85 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4151  PilT protein-like  36.5 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0505  putative plasmid stability protein  35 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.294814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0713  PilT domain-containing protein  31.88 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0469  PilT domain-containing protein  33.58 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  32.14 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4710  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3797  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3455  PilT protein, N-terminal  36.36 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2332  PilT protein-like  29.93 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.221502 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4581  PilT protein-like  34.06 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.766949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1045  PilT domain-containing protein  30.22 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0543043  normal  0.324928 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3569  PilT protein domain protein  31.91 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  31.62 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  32.41 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2505  PilT protein domain protein  32.39 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2075  PilT domain-containing protein  33.57 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0728  PilT protein domain protein  34.29 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  28.89 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  33.65 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  34.33 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7721  plasmid stability protein  30 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.859418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2339  PilT protein domain protein  28.15 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6402  PilT protein domain protein  34.51 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1710  PilT domain-containing protein  34.53 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.164761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  34.03 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  62  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  36.9 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3192  PilT domain-containing protein  31.43 
 
 		 141 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.4 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  31.65 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3180  PilT domain-containing protein  31.65 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0624  PilT protein-like  29.41 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.810517  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3418  PilT protein, N-terminal  30.94 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.0554428 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4674  PilT protein domain protein  30.66 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  35.82 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  33.8 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  30.71 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  31.2 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  33.6 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2919  PilT protein domain protein  32.37 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  31.2 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  31.65 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  33.6 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  27.78 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  29.85 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  30.07 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  34.33 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4334  PilT domain-containing protein  34.53 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2934  PilT protein-like  31.21 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.119744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  35.43 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4749  PilT domain-containing protein  32.17 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1709  PilT protein-like  29.58 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4284  prevent-host-death protein  30.71 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.600657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  31.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  31.03 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  30.56 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  30.28 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  33.06 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>