More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0037 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0037  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.251395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0052  lipoprotein signal peptidase  94.61 
 
 		 167 aa  320  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  71.61 
 
 		 165 aa  231  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0415  lipoprotein signal peptidase  66.43 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0161  lipoprotein signal peptidase  49.3 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0144  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 160 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0149  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 160 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3678  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1375  lipoprotein signal peptidase  43.84 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  39.31 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  41.4 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.95 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  40.48 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.09 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  34.15 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  36.6 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  36.18 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  38.89 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  35.8 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  35.53 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 		 176 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.34 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  36.43 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 202 aa  94.4  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  39.16 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  36.59 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.89 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  34.16 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  34.9 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  39.39 
 
 		 166 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  34.44 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 176 aa  90.9  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  37.32 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 154 aa  90.5  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  35.86 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  39.07 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  38.18 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  35.95 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  32.5 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 178 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.31 
 
 		 169 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 182 aa  88.2  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  34.18 
 
 		 171 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  35.42 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 163 aa  87.4  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  38.46 
 
 		 150 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 235 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  32.85 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  36.55 
 
 		 163 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  38.52 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  39.52 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  36.05 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>