More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0034 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 329 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  88.04 
 
 		 329 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  50.61 
 
 		 338 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  52.13 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  52.58 
 
 		 333 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  46.95 
 
 		 343 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  47.56 
 
 		 339 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 341 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 352 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 336 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  43.43 
 
 		 198 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 		 325 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 334 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  48.48 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 341 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  39.67 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.49 
 
 		 338 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0317  transcriptional regulator, AraC family  41.6 
 
 		 362 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 392 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  38.02 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.11 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.06 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  41.51 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4405  transcriptional regulator, AraC family  45.71 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  25.53 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08570  transcriptional activator, BenR (AraC family)  42.72 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4516  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  30.88 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  29.68 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2976  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2688  transcriptional regulator EutR  39.22 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2647  transcriptional regulator EutR  39.22 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  34.33 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2599  transcriptional regulator EutR  39.22 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2714  transcriptional regulator EutR  39.22 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  34.13 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2982  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 327 aa  79  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0156275  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02337  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2821  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  38.24 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>