More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0032 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  56.44 
 
 		 925 aa  874    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  62.5 
 
 		 914 aa  1142    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  60 
 
 		 929 aa  922    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 		 820 aa  708    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  60.88 
 
 		 921 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  52.45 
 
 		 904 aa  838    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  71.28 
 
 		 910 aa  1282    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  59.18 
 
 		 962 aa  921    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  60.75 
 
 		 907 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  57.32 
 
 		 876 aa  882    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 872 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 868 aa  645    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  59.21 
 
 		 896 aa  948    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  59.62 
 
 		 905 aa  900    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  43.43 
 
 		 804 aa  709    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  60.25 
 
 		 888 aa  1013    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  55.98 
 
 		 919 aa  894    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  59.82 
 
 		 916 aa  952    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  57.18 
 
 		 875 aa  893    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  81.5 
 
 		 915 aa  1402    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  56.88 
 
 		 878 aa  903    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  49.55 
 
 		 904 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  41.85 
 
 		 872 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  59.26 
 
 		 916 aa  949    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  59.93 
 
 		 908 aa  975    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  71.4 
 
 		 898 aa  1283    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  57.64 
 
 		 929 aa  910    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  79.71 
 
 		 883 aa  1412    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  60.18 
 
 		 911 aa  1014    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  49.04 
 
 		 858 aa  742    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  43.67 
 
 		 804 aa  705    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  54.82 
 
 		 877 aa  870    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  60.4 
 
 		 882 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 880 aa  1769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  60.34 
 
 		 923 aa  1009    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  60.36 
 
 		 907 aa  1033    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  95.57 
 
 		 908 aa  1659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  57.35 
 
 		 879 aa  949    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  48.8 
 
 		 864 aa  714    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  72.78 
 
 		 881 aa  1258    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  57.79 
 
 		 877 aa  921    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  57.18 
 
 		 880 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  52.87 
 
 		 897 aa  823    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  72.08 
 
 		 910 aa  1302    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  59.05 
 
 		 910 aa  1009    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  48.43 
 
 		 873 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.63 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 815 aa  624  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  41.13 
 
 		 871 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.78 
 
 		 869 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  41.14 
 
 		 882 aa  611  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.2 
 
 		 859 aa  609  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  40.26 
 
 		 872 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  40.42 
 
 		 891 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 853 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 870 aa  599  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  38.25 
 
 		 869 aa  601  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  40.79 
 
 		 880 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  40.33 
 
 		 900 aa  598  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 		 855 aa  598  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 853 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.05 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  46.45 
 
 		 882 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  41.31 
 
 		 855 aa  592  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  39.89 
 
 		 862 aa  592  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 932 aa  592  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 855 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  40.97 
 
 		 855 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  39.22 
 
 		 873 aa  588  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 857 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  40.68 
 
 		 857 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  44.43 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 855 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 881 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 860 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.25 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  39.33 
 
 		 863 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 892 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 851 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  39.29 
 
 		 889 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 859 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 		 882 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.37 
 
 		 870 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 884 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.66 
 
 		 884 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 857 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 880 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 862 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  40.04 
 
 		 854 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 851 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3142  DNA mismatch repair protein MutS  40.43 
 
 		 852 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  40.95 
 
 		 854 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  38.48 
 
 		 856 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  39.31 
 
 		 902 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.59 
 
 		 887 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 859 aa  571  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 856 aa  571  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.66 
 
 		 878 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.32 
 
 		 861 aa  569  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>