238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0030 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  61.76 
 
 		 934 aa  1172    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  71.52 
 
 		 941 aa  1378    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  45.37 
 
 		 941 aa  718    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  54.43 
 
 		 928 aa  961    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  55.63 
 
 		 925 aa  974    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  52.81 
 
 		 1029 aa  925    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  41.47 
 
 		 930 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  41.83 
 
 		 930 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  54.51 
 
 		 937 aa  934    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  41.8 
 
 		 943 aa  720    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  73.88 
 
 		 949 aa  1412    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  47.47 
 
 		 936 aa  797    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  55.07 
 
 		 932 aa  964    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  43.92 
 
 		 912 aa  723    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  41 
 
 		 914 aa  668    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  55.18 
 
 		 931 aa  1014    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  95.97 
 
 		 968 aa  1867    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  54.43 
 
 		 928 aa  964    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  53.28 
 
 		 933 aa  981    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  54.95 
 
 		 931 aa  986    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  41.99 
 
 		 893 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  44.17 
 
 		 935 aa  738    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  62.92 
 
 		 934 aa  1191    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  64.16 
 
 		 912 aa  1107    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  55.65 
 
 		 969 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  52.15 
 
 		 931 aa  934    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  61.66 
 
 		 934 aa  1170    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  54.65 
 
 		 928 aa  967    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  43.46 
 
 		 936 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  52.61 
 
 		 953 aa  900    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  56.1 
 
 		 931 aa  1009    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  53.98 
 
 		 935 aa  956    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  55.68 
 
 		 933 aa  998    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  100 
 
 		 968 aa  1986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  41.47 
 
 		 930 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  52.56 
 
 		 936 aa  928    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  41.31 
 
 		 938 aa  629  1e-179  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3022  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  41.48 
 
 		 936 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  38.29 
 
 		 989 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.55 
 
 		 924 aa  515  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  32.77 
 
 		 902 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.9 
 
 		 894 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  31.99 
 
 		 899 aa  445  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  34.12 
 
 		 900 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.11 
 
 		 894 aa  445  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 		 900 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  33.8 
 
 		 900 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  34.21 
 
 		 899 aa  442  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  34.85 
 
 		 900 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  34.12 
 
 		 900 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  34 
 
 		 900 aa  439  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  33.41 
 
 		 899 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  33.88 
 
 		 899 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  32.82 
 
 		 906 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  31.14 
 
 		 900 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  34.64 
 
 		 893 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.63 
 
 		 900 aa  435  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 900 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 898 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2457  PII uridylyl-transferase  34.03 
 
 		 859 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100241  hitchhiker  0.00205013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1433  PII uridylyl-transferase  33.37 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  34.1 
 
 		 862 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  34.1 
 
 		 862 aa  426  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.88 
 
 		 894 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2983  PII uridylyl-transferase  33.89 
 
 		 890 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1679  PII uridylyl-transferase  33.7 
 
 		 859 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0894657  normal  0.0862944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  32.35 
 
 		 892 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2633  PII uridylyl-transferase  33.84 
 
 		 887 aa  416  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  33.06 
 
 		 930 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1532  PII uridylyl-transferase  32.89 
 
 		 856 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0731964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1255  PII uridylyl-transferase  33.42 
 
 		 858 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0751944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  32.98 
 
 		 892 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.87 
 
 		 930 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1402  PII uridylyl-transferase  33.09 
 
 		 861 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1340  PII uridylyl-transferase  32.69 
 
 		 859 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490148  normal  0.451762 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1883  PII uridylyl-transferase  32.76 
 
 		 869 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.779236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  31.96 
 
 		 905 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  32.75 
 
 		 930 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3437  PII uridylyl-transferase  33.11 
 
 		 893 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  33.49 
 
 		 898 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2025  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 		 858 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3362  PII uridylyl-transferase  33.58 
 
 		 903 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1011  PII uridylyl-transferase  33.11 
 
 		 893 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1064  PII uridylyl-transferase  33.11 
 
 		 912 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2054  PII uridylyl-transferase  33.42 
 
 		 858 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1923  PII uridylyl-transferase  33.42 
 
 		 858 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.289399 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00165  PII uridylyl-transferase  33.81 
 
 		 890 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  33.09 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0783  PII uridylyl-transferase  32.37 
 
 		 850 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.483078 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2041  PII uridylyl-transferase  33.21 
 
 		 858 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  33.13 
 
 		 858 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6056  PII uridylyl-transferase  33.21 
 
 		 858 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.399672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0159  PII uridylyl-transferase  33.69 
 
 		 890 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0691765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3493  PII uridylyl-transferase  33.81 
 
 		 890 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.761936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  33.54 
 
 		 864 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0939  PII uridylyl-transferase  33.46 
 
 		 904 aa  406  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119925  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  32.49 
 
 		 885 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00164  hypothetical protein  33.81 
 
 		 890 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.920413  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  33.91 
 
 		 858 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  33.05 
 
 		 893 aa  405  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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