86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4450 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 92 aa  191  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  83.7 
 
 		 101 aa  170  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  64.52 
 
 		 93 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  64.52 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  64.52 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  63.04 
 
 		 92 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  56.52 
 
 		 92 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  50 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  53.26 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  47.83 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  47.83 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  45.65 
 
 		 92 aa  90.9  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  39.36 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  40.86 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  40.22 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  38.2 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  43.01 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  35.87 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  38.3 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 92 aa  68.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  38.71 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  47.14 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  35.87 
 
 		 91 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  39.78 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  37.36 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  40.98 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  36.96 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  34.78 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  62.16 
 
 		 51 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  48.33 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  48.33 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3186  plasmid maintenance system killer  36.17 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  29.03 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  34.15 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  29.03 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  36.51 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1215  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  31.96 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  31.96 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  31.96 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  26.88 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  34.15 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0673  plasmid maintenance system killer protein  35.09 
 
 		 91 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.139891  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  31.58 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0020  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184323  normal  0.0200834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  29.47 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  31.96 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  31.71 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2895  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.541001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4140  plasmid maintenance system killer  29.35 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3069  plasmid maintenance system killer  30.43 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  32.47 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1124  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.178606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2105  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  32.26 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1212  plasmid maintenance system killer  33.68 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  28.42 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  29.03 
 
 		 92 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>