More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4193 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 226 aa  470  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  33.18 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  33 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  33.84 
 
 		 389 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 214 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  35.37 
 
 		 240 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  33.01 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.04 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.35 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.35 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 		 232 aa  85.5  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  31.87 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.53 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.43 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  34.45 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.52 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  28.76 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  29.46 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  27.88 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  27.69 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  28.37 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  25.81 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  33.64 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  31.86 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  31.75 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  31.72 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  36.5 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  30.99 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.08 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  29.7 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  34.64 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.27 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  29.69 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  27.47 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  29.77 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5384  isochorismatase hydrolase  32.86 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  32.14 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  29.21 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  30.05 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0336  isochorismatase hydrolase  33.6 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.499522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  28.11 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1254  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30.51 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.06 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  27.75 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  27.36 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  29.01 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.84 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1280  isochorismatase family protein  31.78 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  30.4 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1382  isochorismatase family protein  31.78 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.030054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3927  isochorismatase family protein  32.56 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1454  isochorismatase family protein  31.78 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.40872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1523  isochorismatase family protein  28.32 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  33.61 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  28.38 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  25.89 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  33.33 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  34.15 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  25.98 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  32.59 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3089  N-carbamoylsarcosine amidase  31.47 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109998  hitchhiker  0.000000410333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  33.59 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  34.71 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>