24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4150 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4149  hypothetical protein  52.54 
 
 		 208 aa  195  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0480  hypothetical protein  51.28 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.58191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0475  hypothetical protein  50.64 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3151  hypothetical protein  46.2 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3440  hypothetical protein  51.28 
 
 		 202 aa  155  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0485749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3235  hypothetical protein  47.34 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1284  hypothetical protein  47.34 
 
 		 193 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.103295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0197  hypothetical protein  41.92 
 
 		 212 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0447  hypothetical protein  51.27 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0057  hypothetical protein  47.02 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0055  hypothetical protein  44.15 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000944015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3458  hypothetical protein  45.34 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3698  hypothetical protein  38.62 
 
 		 211 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3544  hypothetical protein  48.28 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2973  hypothetical protein  43.72 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1621  hypothetical protein  44.23 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1187  hypothetical protein  47.2 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326391  normal  0.0440616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1177  hypothetical protein  47.2 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1160  hypothetical protein  47.2 
 
 		 203 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1500  hypothetical protein  44.8 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624694  normal  0.50616 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3987  hypothetical protein  44.6 
 
 		 158 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3678  hypothetical protein  40.37 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1837  hypothetical protein  42.95 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>