More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3941 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  66.67 
 
 
261 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.22 
 
 
261 aa  345  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  58.02 
 
 
271 aa  311  7e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  58.02 
 
 
271 aa  309  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  63.71 
 
 
269 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  55.98 
 
 
270 aa  301  7e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  62.35 
 
 
268 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5189  protein serine/threonine phosphatase  50.61 
 
 
266 aa  261  7e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  48.29 
 
 
274 aa  231  8e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  42.68 
 
 
276 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  40.32 
 
 
296 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0866  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
293 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.654153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  38.81 
 
 
267 aa  172  7e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.6 
 
 
247 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.27 
 
 
252 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  37.5 
 
 
249 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  37.65 
 
 
257 aa  164  2e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  36.48 
 
 
245 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.79403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.72 
 
 
237 aa  162  4e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  37.75 
 
 
254 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.71 
 
 
238 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  38.04 
 
 
256 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.08 
 
 
238 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  38.33 
 
 
425 aa  156  3e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  39.69 
 
 
256 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
395 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  36.02 
 
 
250 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5661e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2765  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.45 
 
 
419 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0318  serine/threonine phosphatase, putative  40.59 
 
 
245 aa  152  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
256 aa  152  6e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
256 aa  152  6e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
259 aa  152  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.92 
 
 
416 aa  151  9e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.53 
 
 
258 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  30.92 
 
 
273 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.14 
 
 
240 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.98 
 
 
243 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 
250 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  38.65 
 
 
538 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  40.08 
 
 
441 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  36.59 
 
 
250 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  36.59 
 
 
250 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3671  putative serine/threonine phosphatase  36.47 
 
 
246 aa  148  1e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  36.73 
 
 
244 aa  147  1e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  34.92 
 
 
417 aa  147  1e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.66 
 
 
236 aa  147  1e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  35.37 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  36.18 
 
 
250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  41.25 
 
 
239 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  38.65 
 
 
415 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  37.65 
 
 
255 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  37.66 
 
 
236 aa  145  7e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  34.96 
 
 
250 aa  145  8e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
241 aa  145  8e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  34.96 
 
 
250 aa  145  8e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  34.96 
 
 
250 aa  145  8e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  34.96 
 
 
250 aa  145  8e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.35 
 
 
239 aa  145  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  34.55 
 
 
250 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.62 
 
 
241 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  36.78 
 
 
245 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  35.25 
 
 
259 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.23411e-06  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  38.13 
 
 
452 aa  142  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.33 
 
 
505 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  34.68 
 
 
246 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  35.16 
 
 
548 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  35.48 
 
 
253 aa  141  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  34.84 
 
 
259 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  35.74 
 
 
455 aa  141  1e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
241 aa  141  1e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  37.02 
 
 
239 aa  141  1e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36 
 
 
470 aa  140  2e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 
540 aa  140  2e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  38.68 
 
 
234 aa  140  2e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
394 aa  140  2e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  32.93 
 
 
250 aa  140  2e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 
449 aa  140  2e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 
252 aa  140  2e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  34.38 
 
 
445 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  31.42 
 
 
361 aa  139  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  32.5 
 
 
236 aa  139  5e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  40.59 
 
 
467 aa  138  9e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 
386 aa  138  9e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.08 
 
 
469 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2391  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 
422 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55488  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  35.27 
 
 
246 aa  138  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  38.24 
 
 
474 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0530  serine/threonine protein phosphatase, putative  34.14 
 
 
249 aa  137  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.467374  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.51 
 
 
500 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  34.4 
 
 
245 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  39.33 
 
 
472 aa  136  3e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 
320 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  40.85 
 
 
514 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  37.92 
 
 
477 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  35.89 
 
 
567 aa  135  6e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.59 
 
 
319 aa  135  7e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  38.8 
 
 
264 aa  135  7e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
313 aa  135  7e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  38.98 
 
 
381 aa  134  1e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>