More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3940 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  100 
 
 
225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  73.21 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  66.52 
 
 
220 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  64.35 
 
 
228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  64.29 
 
 
219 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  62.05 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  61.61 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  58.74 
 
 
188 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  59.66 
 
 
236 aa  242  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  52.05 
 
 
237 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5188  FHA domain containing protein  51.77 
 
 
218 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  44.08 
 
 
250 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2735  FHA domain-containing protein  45.33 
 
 
213 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285351  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  44.64 
 
 
234 aa  187  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  42.74 
 
 
236 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  34.83 
 
 
269 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0436  hypothetical protein  32.19 
 
 
230 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  29.39 
 
 
244 aa  95.1  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  29.06 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3491  FHA domain containing protein  47.3 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  42.39 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22590  FHA domain-containing protein  38.96 
 
 
152 aa  72  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.781297  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5356  FHA domain containing protein  38.96 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  40.66 
 
 
97 aa  71.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  41.56 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2434  FHA domain containing protein  41.03 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00264365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  43.66 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  44 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  47.95 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0473  hypothetical protein  38.96 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.592992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  40.26 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  40.26 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  44 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
134 aa  67.4  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1117  FHA domain-containing protein  34.74 
 
 
116 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0556817  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  37.66 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4002  FHA domain-containing protein-like protein  41.03 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.759759  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  37.66 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2844  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2888  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2875  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  40.26 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  40.26 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3402  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10779  normal  0.511824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  44.16 
 
 
1004 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3135  FHA domain-containing protein  36.36 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547801  normal  0.0667215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  41.1 
 
 
279 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  39.71 
 
 
518 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  33.63 
 
 
1011 aa  64.7  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2726  FHA domain containing protein  37.66 
 
 
170 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  38.37 
 
 
408 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4010  FHA domain containing protein  38.96 
 
 
156 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.196899  normal  0.106089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1395  forkhead-associated  41.1 
 
 
178 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  42.03 
 
 
242 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  34.78 
 
 
518 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.61 
 
 
513 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  47.95 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  41.18 
 
 
515 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13850  FHA domain-containing protein  40 
 
 
141 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.38 
 
 
903 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1309  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2647  FHA domain containing protein  35.06 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2551  FHA domain containing protein  35.06 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  42.47 
 
 
268 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  39.47 
 
 
152 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18260  FHA domain-containing protein  41.33 
 
 
167 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  40.58 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11857  hypothetical protein  36.11 
 
 
162 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.751406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0798  FHA domain protein  36.36 
 
 
146 aa  62.4  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  37.04 
 
 
294 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2775  Forkhead-associated protein  37.5 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.38 
 
 
899 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0036  FHA domain protein  44 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.44 
 
 
427 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
242 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1377  hypothetical protein  41.33 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  37.97 
 
 
253 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13440  FHA domain-containing protein  32.5 
 
 
149 aa  61.6  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1738  FHA domain containing protein  37.33 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  36.84 
 
 
546 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0753  FHA domain containing protein  31.71 
 
 
138 aa  61.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000612633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0032  FHA domain containing protein  40 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  37.21 
 
 
474 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  39.13 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  39.08 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07300  FHA domain-containing protein  31.58 
 
 
144 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1542  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
158 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2339  FHA domain containing protein  37.33 
 
 
146 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.53176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.1 
 
 
890 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  37.23 
 
 
1065 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  38.67 
 
 
174 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
138 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  38.1 
 
 
149 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  32.89 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  36.46 
 
 
245 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1710  FHA domain-containing protein  43.24 
 
 
168 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  40 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0726  FHA domain containing protein  34.34 
 
 
198 aa  59.3  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  42.5 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  36.59 
 
 
150 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>