More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3913 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  100 
 
 		 132 aa  255  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  44.17 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  53.33 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 220 aa  98.2  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  47.17 
 
 		 269 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  52 
 
 		 110 aa  97.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  52.38 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 		 133 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  51.72 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  49.49 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  45.05 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  45.05 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.24 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  53.41 
 
 		 356 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  53.41 
 
 		 356 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  49.04 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  53.41 
 
 		 356 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.34 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  46.74 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  44.12 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  50.5 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  51.14 
 
 		 356 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  43.33 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  34.09 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  51.14 
 
 		 356 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  46.36 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  43.96 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  43.69 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  84.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.98 
 
 		 346 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  43.27 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  45.88 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.05 
 
 		 141 aa  84  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  40.98 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  41.76 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.31 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.95 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  46.53 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  40.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  49.44 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  48.19 
 
 		 103 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 98 aa  80.5  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  48.05 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  44.76 
 
 		 480 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  37.63 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.74 
 
 		 389 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  33.9 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  42.71 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.46 
 
 		 395 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  38.64 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  46.43 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.38 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  44 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.8 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  45.98 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  43.88 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  45.98 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  36.27 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  47.19 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39.77 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.41 
 
 		 108 aa  76.6  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  47.13 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  44.44 
 
 		 711 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  46.75 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2680  rhodanese-like protein  46.81 
 
 		 105 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.92 
 
 		 480 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.07 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  35.16 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.46 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  42.27 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.62 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1253  rhodanese domain-containing protein  38.84 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000299854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  44.19 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.13 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>