More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3850 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3850  signal-transduction protein  100 
 
 		 153 aa  296  5e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1528  signal-transduction protein  87.58 
 
 		 153 aa  266  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2557  hypothetical protein  42.76 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0067  putative inosine monophosphate dehydrogenase  45.14 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0583  CBS domain-containing protein  43.62 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00772647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1388  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2033  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2323  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1343  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1057  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.486416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2317  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.754062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3091  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 291 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.105353  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3216  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1429  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 		 211 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1169  signal-transduction protein  42.24 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  38.62 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2342  CBS domain-containing protein  41.01 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.72552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0248  putative signal transduction protein with CBS domains  35.57 
 
 		 149 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1150  CBS  39.72 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5931  CBS domain-containing protein  42.37 
 
 		 149 aa  90.9  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  44.88 
 
 		 150 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7035  CBS domain-containing protein  42.4 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.819335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6177  CBS domain-containing protein  43.22 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  37.6 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4418  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.2 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4551  putative signal transduction protein with CBS domains  43.2 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.610614  normal  0.0178706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3669  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0920  CBS domain-containing protein  35.88 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5919  signal-transduction protein  36.64 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512609  normal  0.346148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7033  signal-transduction protein  38.4 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365249  normal  0.472984 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  29.1 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4435  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  38.84 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4568  putative signal transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0446023  normal  0.17585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  35.56 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2620  putative signal transduction protein with CBS domains  38.94 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0774627  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.45 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3235  hypothetical protein  36.19 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  34.48 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1809  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.17 
 
 		 478 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  30.71 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  34.43 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  36.97 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  34.29 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 		 1274 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  34.85 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0183  hypothetical protein  33.08 
 
 		 165 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  29.71 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  33.08 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  37.29 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  31.53 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  36.97 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2788  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.190959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  32.19 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.65 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  32.48 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1249  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6583  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0267  cyclic nucleotide-binding protein  30.2 
 
 		 625 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6186  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  29.93 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  30.89 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0631  signal-transduction protein  31.37 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0255  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0155982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2950  signal transduction protein  36.97 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.211508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  29.32 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  32.33 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  35.61 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5536  CBS domain-containing protein  35.92 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0354137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.83 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 629 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  29.73 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  36.29 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  38.83 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  35.59 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4379  signal-transduction protein  36.22 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  30.14 
 
 		 629 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  30.95 
 
 		 615 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  36.89 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  37.7 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  32.54 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  27.03 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4760  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462026  normal  0.418108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  31.58 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  38.39 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  27.93 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1425  signal-transduction protein  44.14 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.316039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0876  signal-transduction protein  35.25 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  37.82 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12645  hypothetical protein  33.06 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  33.03 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>