More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3822 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 501 aa  991    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  68.79 
 
 		 491 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  67.7 
 
 		 514 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  65.22 
 
 		 504 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  64.03 
 
 		 503 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  63.6 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  56.11 
 
 		 504 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  56.07 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  58.52 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  56.07 
 
 		 492 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  55.17 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  57.84 
 
 		 490 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  56.03 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  55.72 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  56.22 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  55.33 
 
 		 494 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  55.88 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  55.16 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  55.16 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  55.16 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  55.11 
 
 		 494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  55.16 
 
 		 495 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  55.88 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  54.95 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  55.16 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  55.16 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  55.88 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  55.16 
 
 		 483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  54.61 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  55.65 
 
 		 493 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  54.39 
 
 		 504 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  54.85 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  48.61 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  51.09 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  49.47 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  49.47 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  49.47 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  50.43 
 
 		 489 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  48.48 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  46.22 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  47.4 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  47.95 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  46.51 
 
 		 482 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  45.22 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  47.53 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  45.22 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  47.39 
 
 		 477 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  47.39 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  45.22 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  46.74 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  47.17 
 
 		 492 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  46.07 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  45.87 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  45.42 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  45.57 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  45.57 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  45.45 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  45.45 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  45.42 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  45.45 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  46.07 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  45.93 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  45.81 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  47.7 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  45.59 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  45.44 
 
 		 499 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  44.95 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  46.27 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  43.54 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  45.99 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  45.92 
 
 		 490 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  45.22 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  45.88 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  46.24 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  44.01 
 
 		 507 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  45.57 
 
 		 483 aa  363  3e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  43.72 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  45.8 
 
 		 492 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  43.95 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  44.67 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  45.03 
 
 		 469 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  44.03 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42.92 
 
 		 481 aa  359  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  41.63 
 
 		 503 aa  356  5e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  41.9 
 
 		 498 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  43.1 
 
 		 516 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  41.82 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  43.01 
 
 		 476 aa  350  5e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  45.05 
 
 		 489 aa  348  9e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  43.22 
 
 		 490 aa  349  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  42.92 
 
 		 487 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  41.98 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  41.94 
 
 		 505 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  43.79 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  42.68 
 
 		 493 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  44.33 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  39.42 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  43.06 
 
 		 514 aa  330  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  44.44 
 
 		 511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  42.71 
 
 		 514 aa  326  5e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>