More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3737 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36.26 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  32.4 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 229 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 207 aa  95.1  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.4 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  30.96 
 
 		 222 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.47 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.9 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.9 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.38 
 
 		 220 aa  89  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  34.33 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  32.99 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 		 232 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  29.5 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.25 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.9 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.83 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  30.21 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.14 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.15 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  31.61 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.2 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.66 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.26 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.48 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>