More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3703 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3703  OmpA/MotB  100 
 
 
314 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3089  OmpA/MotB domain protein  63.96 
 
 
313 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  63.64 
 
 
313 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  66.9 
 
 
312 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0603  OmpA/MotB domain-containing protein  63.57 
 
 
345 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  59.03 
 
 
320 aa  356  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4422  OmpA/MotB domain-containing protein  56.47 
 
 
327 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2873  chemotaxis signal transduction protein CheY  57.59 
 
 
320 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  58.48 
 
 
308 aa  332  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  53.42 
 
 
316 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  56.47 
 
 
319 aa  309  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3226  OmpA/MotB domain protein  51.95 
 
 
330 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0410363  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  48.73 
 
 
308 aa  285  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  46.01 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  49.14 
 
 
335 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  48.8 
 
 
335 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  48.81 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  48.81 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  48.81 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  48.46 
 
 
344 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  48.46 
 
 
338 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  49.83 
 
 
338 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  44.16 
 
 
308 aa  266  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  49.15 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  49.15 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  49.15 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5607  flagellar motor protein MotB  46.93 
 
 
325 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  46.94 
 
 
358 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  48.81 
 
 
339 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  48.81 
 
 
339 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  44.72 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4158  flagellar motor protein MotB  50.18 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270622  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4046  flagellar motor protein MotB  50.18 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.475556  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  46.01 
 
 
451 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  46.01 
 
 
421 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  46.01 
 
 
433 aa  251  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1410  flagellar motor protein MotB  50.56 
 
 
314 aa  249  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.296374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  47.37 
 
 
325 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  44.52 
 
 
376 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  43.79 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  46.92 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.5 
 
 
318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  47.48 
 
 
329 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  44.17 
 
 
377 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  45.72 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  43.2 
 
 
306 aa  242  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  43.46 
 
 
321 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0438  flagellar motor protein MotB  45.4 
 
 
318 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4157  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
315 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2612  OmpA/MotB domain protein  44.88 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1854  OmpA/MotB domain protein  44.13 
 
 
350 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00497305  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  42.6 
 
 
312 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  42.6 
 
 
312 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4952  chemotaxis motB protein  44.44 
 
 
341 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.457077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2025  OmpA/MotB  43.66 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0231038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  43.93 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0562  flagellar motor protein MotB  43.4 
 
 
349 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  39.93 
 
 
296 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2778  OmpA/MotB domain-containing protein  42.75 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0513  flagellar motor protein MotB  44.25 
 
 
355 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
339 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4780  flagellar motor protein MotB  43.2 
 
 
346 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  43.6 
 
 
329 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4904  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
346 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  43.36 
 
 
342 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  43.71 
 
 
347 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4957  flagellar motor protein MotB  42.86 
 
 
350 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 
298 aa  206  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  39.5 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1504  OmpA/MotB domain-containing protein  38.75 
 
 
285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.962914  normal  0.610699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  52.38 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  52.38 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  35.54 
 
 
346 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  40.21 
 
 
286 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1555  OmpA/MotB domain-containing protein  37.91 
 
 
307 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00240809  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2640  OmpA/MotB domain-containing protein  35.84 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0239929  hitchhiker  0.00000281667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  34.3 
 
 
307 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  34.29 
 
 
307 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  159  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  41.61 
 
 
325 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 
299 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 
313 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  36.84 
 
 
287 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  32.17 
 
 
303 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  31.76 
 
 
330 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001165  Flagellar motor rotation protein MotB  31.91 
 
 
330 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  29.32 
 
 
336 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 
334 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>