194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3664 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2139  arsenite-activated ATPase ArsA  75.17 
 
 
587 aa  885    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2637  anion-transporting ATPase  76.62 
 
 
590 aa  885    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473292  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3664  arsenite-activated ATPase (arsA)  100 
 
 
589 aa  1186    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1491  arsenite-activated ATPase (arsA)  75.68 
 
 
587 aa  893    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.738172  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0650  arsenite-activated ATPase ArsA  75.72 
 
 
588 aa  887    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0171508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0209  arsenite-activated ATPase ArsA  59.8 
 
 
621 aa  670    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2343  arsenite-activated ATPase ArsA  67.12 
 
 
588 aa  757    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000653299  normal  0.0206512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2121  arsenical pump-driving ATPase  68.54 
 
 
586 aa  806    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000832973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  65.7 
 
 
729 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2187  arsenical pump-driving ATPase  68.42 
 
 
586 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1654  arsenite-activated ATPase ArsA  64.46 
 
 
589 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257726  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3828  arsenite-activated ATPase ArsA  66.95 
 
 
588 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000120267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01495  oxyanion-translocating ATPase  59.15 
 
 
582 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3731  arsenite-activated ATPase ArsA  52.63 
 
 
600 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759868  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0156  arsenite-translocating ATPase ArsA  48.35 
 
 
586 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0306  arsenical pump-driving ATPase  48.35 
 
 
586 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5668  arsenite-activated ATPase ArsA  51.72 
 
 
587 aa  556  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3705  arsenite-activated ATPase ArsA  50.94 
 
 
584 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430131  hitchhiker  0.00279853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1447  arsenite-transporting ATPase  54.71 
 
 
571 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.463523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2710  arsenite-activated ATPase ArsA  52.08 
 
 
571 aa  536  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1347  arsenite-activated ATPase ArsA  49.66 
 
 
586 aa  525  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.128116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2513  arsenite-activated ATPase ArsA  49.31 
 
 
586 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.020196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0184  arsenite-activated ATPase ArsA  47.85 
 
 
603 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.156138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2152  arsenite-activated ATPase ArsA  44.21 
 
 
582 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1381  arsenite-activated ATPase ArsA  48.5 
 
 
583 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1189  arsenite-activated ATPase ArsA  45.92 
 
 
578 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2390  arsenite-activated ATPase ArsA  45.95 
 
 
579 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0938  arsenite-transporting ATPase  45.95 
 
 
583 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0354  arsenite-activated ATPase ArsA  42.88 
 
 
580 aa  477  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2428  arsenical pump-driving ATPase  37.37 
 
 
565 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.738989  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  33.17 
 
 
640 aa  332  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  33.28 
 
 
643 aa  319  7.999999999999999e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  31.76 
 
 
456 aa  145  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  0.000000394119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  39.22 
 
 
311 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2410  arsenite-transporting ATPase  26.75 
 
 
634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  34.31 
 
 
318 aa  110  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  27.78 
 
 
405 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  27.78 
 
 
407 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03090  oxyanion-translocating ATPase  34.08 
 
 
322 aa  100  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2829  arsenite-activated ATPase ArsA  25.87 
 
 
637 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  30.2 
 
 
433 aa  99.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  25.12 
 
 
406 aa  99  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  29.8 
 
 
433 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  25.44 
 
 
405 aa  98.6  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2327  arsenite-activated ATPase ArsA  23.64 
 
 
626 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.761686  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32803  predicted protein  25.86 
 
 
800 aa  96.3  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  29.96 
 
 
434 aa  96.7  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  29.41 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  27.51 
 
 
405 aa  96.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  27.08 
 
 
401 aa  95.9  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  29.02 
 
 
433 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  26.49 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1206  arsenite-activated ATPase ArsA  27.3 
 
 
331 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  30.74 
 
 
433 aa  95.5  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  25.89 
 
 
408 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  25.89 
 
 
407 aa  95.1  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  27.18 
 
 
395 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  27.06 
 
 
408 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  26.19 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  30.94 
 
 
434 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  26.86 
 
 
397 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  30.15 
 
 
393 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  26.86 
 
 
397 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  28.16 
 
 
395 aa  90.9  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22896  predicted protein  30.15 
 
 
349 aa  90.1  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40985  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48071  pump-driving ATPase  28.51 
 
 
347 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0118158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  27.18 
 
 
394 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  29.37 
 
 
345 aa  89  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  27.04 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  28.3 
 
 
394 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  26.54 
 
 
395 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02640  conserved hypothetical protein  30.83 
 
 
325 aa  87  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14448  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  25.38 
 
 
334 aa  87  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  25.99 
 
 
392 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  29.1 
 
 
345 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  29 
 
 
344 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  25.97 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  26.52 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  28.79 
 
 
341 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  25.96 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  29.48 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  26.64 
 
 
393 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2005  arsenite-activated ATPase (arsA)  31.17 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.41819  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0450  arsenite-transporting ATPase  25.76 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0025028  hitchhiker  0.000316077 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  27.53 
 
 
395 aa  84  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  26.9 
 
 
396 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  26.43 
 
 
385 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  26.4 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  24.67 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  24.22 
 
 
334 aa  82.8  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0069  anion-transporting ATPase  23.4 
 
 
635 aa  81.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127982  hitchhiker  0.00261779 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  26.32 
 
 
393 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  26.64 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  29.34 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  24.83 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1297  arsenite-transporting ATPase  27.69 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2712  arsenite-activated ATPase ArsA  29.46 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  29.41 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  26.64 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  26.32 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>