200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3637 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  100 
 
 		 192 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1661  nitroreductase  60.75 
 
 		 214 aa  222  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.923365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4587  nitroreductase  58.56 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3754  nitroreductase  53.76 
 
 		 220 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.913341  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0931  hypothetical protein  58.6 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1008  nitroreductase  47.8 
 
 		 199 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0434  nitroreductase  56.11 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.751284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0443  nitroreductase  56.11 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  38.92 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  40.54 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  38.25 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3921  nitroreductase  37.64 
 
 		 300 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159011  normal  0.0804264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  39.46 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  40.12 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  39.46 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  38.92 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  38.38 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  32.22 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  36.26 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  33.93 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  33.54 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  36.87 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  28.89 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  33.33 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  30.12 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  28.89 
 
 		 187 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  31.67 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  36.93 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  38.1 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  30.95 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  31.32 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  34.3 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  31.21 
 
 		 191 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  31.21 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  36.81 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  40 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  29.05 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  34.94 
 
 		 221 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  31.98 
 
 		 208 aa  94.4  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  27.07 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  34.3 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  32.34 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  92.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  32.1 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  32.34 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  31.32 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  34.12 
 
 		 183 aa  90.9  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  31.03 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  30.05 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  32.94 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  32.72 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  29.31 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  28.73 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  33.95 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  31.87 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  31.61 
 
 		 205 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  30.27 
 
 		 208 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  28.89 
 
 		 219 aa  85.1  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  30.56 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  32.57 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  34.03 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  28.02 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  27.47 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  29.44 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  33.33 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  26.67 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  28.65 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  29.94 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  32.39 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  31.48 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  34.97 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  29.34 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  28.49 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  30.25 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>