More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3601 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  79.77 
 
 		 263 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  77.48 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.85 
 
 		 266 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  75.19 
 
 		 266 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  73.03 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.81 
 
 		 266 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  74.06 
 
 		 266 aa  374  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  70.99 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  69.96 
 
 		 267 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1209  indole-3-glycerol-phosphate synthase  72.28 
 
 		 267 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.13 
 
 		 261 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  64.12 
 
 		 271 aa  325  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.3 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.67 
 
 		 267 aa  324  8.000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.78 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.67 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3618  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 		 261 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0503  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 		 261 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.883215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2574  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 		 261 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0531  indole-3-glycerol-phosphate synthase  67.05 
 
 		 261 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2912  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 		 261 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2863  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.890478  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.9 
 
 		 261 aa  319  3e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0458  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.75 
 
 		 261 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.9 
 
 		 261 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  66.28 
 
 		 261 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0647  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1913  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0530  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.343706  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0943  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.52 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.9 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  65.27 
 
 		 262 aa  315  4e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.688049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  65.13 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3499  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.84 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.413739  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3475  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.98 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00758651  normal  0.194157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.07 
 
 		 265 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.77 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.77 
 
 		 263 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.79 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.15 
 
 		 266 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.12 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  64.04 
 
 		 267 aa  302  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  62.69 
 
 		 265 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2562  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.21 
 
 		 279 aa  300  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00548778  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  63.67 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  61.36 
 
 		 264 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.33 
 
 		 264 aa  295  5e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1030  indole-3-glycerol-phosphate synthase  62.26 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.92 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  59.16 
 
 		 267 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.23 
 
 		 278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.62 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  60.23 
 
 		 278 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5113  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.76 
 
 		 278 aa  284  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.06 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  58.3 
 
 		 278 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3944  indole-3-glycerol-phosphate synthase  59.85 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.75 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4781  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.53 
 
 		 277 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.574175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.76 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0455  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.811875  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.17 
 
 		 268 aa  275  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.14 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0422  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.76 
 
 		 277 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.909241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  54.17 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  55.6 
 
 		 278 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0452  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.53 
 
 		 277 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.42981  normal  0.418549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.17 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.75 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.95 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0895  indole-3-glycerol-phosphate synthase  50 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.76 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0864  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.62 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.85 
 
 		 266 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.99 
 
 		 268 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.55 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.2 
 
 		 268 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.59 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  53.57 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.78 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2319  indole-3-glycerol phosphate synthase  57.36 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.043656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  55.13 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.22 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.15 
 
 		 266 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  56.4 
 
 		 263 aa  251  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.22 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.22 
 
 		 285 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.6 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  50.96 
 
 		 276 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 285 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1648  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.16 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.43 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  51.33 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.57 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  52.78 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  53.82 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  49.04 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>