More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3305 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  80 
 
 		 215 aa  370  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  75.47 
 
 		 219 aa  342  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  72.86 
 
 		 222 aa  337  7e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  70.7 
 
 		 218 aa  322  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  69.19 
 
 		 230 aa  317  6e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  68.72 
 
 		 213 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  68.37 
 
 		 244 aa  315  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  65.42 
 
 		 220 aa  310  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  72.17 
 
 		 220 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  71.7 
 
 		 220 aa  306  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  65.4 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  52.61 
 
 		 213 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  53.23 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  52.74 
 
 		 221 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  54.19 
 
 		 212 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  47.37 
 
 		 222 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 216 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  44.91 
 
 		 220 aa  204  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  45.83 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  51.64 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  48.04 
 
 		 219 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  43.26 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  48.04 
 
 		 219 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  52.66 
 
 		 215 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  48.04 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  44.7 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  44.75 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  48.54 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  46.15 
 
 		 220 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  47.32 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  47.27 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  45.83 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  45.83 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  45.83 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  46.12 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  47.47 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  47.73 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  49.03 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  47.03 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  48.36 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  46.26 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  47.44 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  47.2 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  50.72 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  47.62 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  47.89 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  47.62 
 
 		 215 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  45.33 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  49.72 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  44.24 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  53.19 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  51.24 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  45.96 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  45.96 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  46.51 
 
 		 253 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  53.72 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  47.03 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  47.03 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  53.72 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  47.03 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  47.03 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  46.58 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  41.23 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  46.58 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  47.37 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  50.75 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  46.12 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  45.21 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  45.41 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  45.18 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  46.79 
 
 		 262 aa  181  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  44.86 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  44.44 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  44.15 
 
 		 245 aa  175  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  46.26 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  46.26 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  41.31 
 
 		 237 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  46.3 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  45.79 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  45.83 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  45.83 
 
 		 244 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  46.49 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  42.18 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  45.25 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  46.86 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  47.31 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  47.59 
 
 		 226 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  40.28 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.2 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>