28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3268 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3268  cyanophycinase-like protein  100 
 
 		 423 aa  849    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.890321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  38.11 
 
 		 348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1651  peptidase S51, dipeptidase E  39.09 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.588878  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2283  cyanophycinase and related exopeptidase-like  32.28 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0740  peptidase S51 dipeptidase E  35.74 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3448  peptidase S51  30.43 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1689  cyanophycinase-like protein  29.95 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1121  peptidase S51 dipeptidase E  33.14 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.575257  hitchhiker  0.00178513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0592  peptidase S51, dipeptidase E  32.29 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4208  cyanophycinase-like protein  30.77 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0438  peptidase S51, dipeptidase E  32.17 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148568  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2840  cyanophycinase-like protein  32 
 
 		 338 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.437386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3283  putative peptidase  32 
 
 		 338 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3909  putative peptidase  31.37 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0172  cyanophycinase  25 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0803268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  24.68 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  24.04 
 
 		 269 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4955  cyanophycinase  27.85 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  28.95 
 
 		 274 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  28.66 
 
 		 273 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  28.03 
 
 		 293 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2760  cyanophycinase  25.45 
 
 		 280 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  29.41 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  30.2 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  26.32 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  23.86 
 
 		 287 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  23.86 
 
 		 287 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  23.35 
 
 		 287 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>