More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3174 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  89.47 
 
 
286 aa  497  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  70.56 
 
 
307 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  67.98 
 
 
263 aa  323  3e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.13 
 
 
265 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  64.02 
 
 
262 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.85 
 
 
355 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0210896  normal  0.899093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.64 
 
 
309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.31 
 
 
303 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  58.2 
 
 
301 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.57 
 
 
301 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
301 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
304 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.08 
 
 
303 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  58.01 
 
 
311 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.91 
 
 
307 aa  271  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.45 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.56 
 
 
299 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1531  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.36 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.71 
 
 
241 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
238 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
238 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.23 
 
 
273 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0096277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.3 
 
 
238 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.53 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
239 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
238 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.45 
 
 
243 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0016  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.45 
 
 
249 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.75 
 
 
242 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.97 
 
 
242 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
243 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.08 
 
 
246 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.3 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  46.3 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.91 
 
 
244 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 
242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
243 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 
242 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.66 
 
 
242 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  46.08 
 
 
262 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.98 
 
 
243 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.33 
 
 
233 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 
249 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.75 
 
 
249 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.01 
 
 
230 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.34 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.13 
 
 
234 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.72 
 
 
253 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.86 
 
 
254 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  45.5 
 
 
243 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.84 
 
 
247 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.73 
 
 
253 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.17 
 
 
250 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.67 
 
 
238 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  42.44 
 
 
254 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.44 
 
 
254 aa  157  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.57 
 
 
247 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  38.12 
 
 
250 aa  156  4e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.19 
 
 
236 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 
201 aa  155  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.50819  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.08 
 
 
266 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.99 
 
 
222 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  40.25 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.67 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.68 
 
 
253 aa  146  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 
238 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 
238 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 
222 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.06 
 
 
222 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 
222 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.19 
 
 
222 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3417  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.08 
 
 
235 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.18 
 
 
235 aa  142  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1663  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.18 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159588  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.72 
 
 
222 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.72 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.29 
 
 
222 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1905  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
238 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.339028  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
232 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>