More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3169 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  83.61 
 
 		 238 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3205  ABC transporter related  83.12 
 
 		 239 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689067  normal  0.429117 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  82.2 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  82.2 
 
 		 242 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  81.78 
 
 		 242 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  79.24 
 
 		 265 aa  394  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  79.24 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  78.15 
 
 		 237 aa  384  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  79.75 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  78.39 
 
 		 241 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2998  ABC transporter related  77.54 
 
 		 242 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.557756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.21 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  75.21 
 
 		 238 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  75.21 
 
 		 238 aa  363  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  75.21 
 
 		 238 aa  362  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  74.37 
 
 		 238 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  71.01 
 
 		 238 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  71.85 
 
 		 238 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  71.43 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  71.43 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  71.43 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  71.43 
 
 		 238 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  71.43 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  71.01 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  71.01 
 
 		 238 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  71.85 
 
 		 238 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  71.85 
 
 		 238 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  69.75 
 
 		 238 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 234 aa  348  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  68.07 
 
 		 238 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  68.94 
 
 		 237 aa  332  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  63.25 
 
 		 234 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  61.11 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  61.97 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  59.24 
 
 		 237 aa  293  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  59.4 
 
 		 235 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2475  ABC transporter related  63.68 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  58.37 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  57.51 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  58.8 
 
 		 234 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  57.08 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  54.7 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.65 
 
 		 234 aa  278  4e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  57.02 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  54.7 
 
 		 235 aa  275  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  56.41 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  54.7 
 
 		 233 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  56.65 
 
 		 233 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.13 
 
 		 236 aa  271  5.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  54.51 
 
 		 235 aa  271  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  56.12 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  56.12 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  54.47 
 
 		 237 aa  271  9e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  54.94 
 
 		 234 aa  271  9e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  54.94 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  55.7 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  53.42 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  55.36 
 
 		 236 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  53.42 
 
 		 236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  54.24 
 
 		 259 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.99 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  54.89 
 
 		 249 aa  267  8.999999999999999e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  54.2 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  55.13 
 
 		 238 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  54.51 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  53.62 
 
 		 239 aa  264  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  54.51 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  52.79 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  53.42 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  52.52 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  52.52 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  54.01 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.26 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20640  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  52.77 
 
 		 239 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.171574  normal  0.883119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  55.32 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.32 
 
 		 241 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  54.01 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.88 
 
 		 237 aa  258  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  53.65 
 
 		 237 aa  256  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  54.89 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  55.36 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 237 aa  255  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 238 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  53.22 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  50.85 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  52.14 
 
 		 242 aa  254  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  54.08 
 
 		 235 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  53.65 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  53.65 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  51.5 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>