272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2943 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  100 
 
 
80 aa  167  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  70 
 
 
82 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  69.74 
 
 
82 aa  124  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  69.74 
 
 
82 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  68.75 
 
 
82 aa  123  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  68.83 
 
 
80 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  66.67 
 
 
81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  69.33 
 
 
85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  62.34 
 
 
82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  57.14 
 
 
81 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  58.11 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  58.11 
 
 
79 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  55.84 
 
 
82 aa  97.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  53.33 
 
 
92 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  55.84 
 
 
79 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  56.76 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  58.11 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  58.11 
 
 
78 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  55.26 
 
 
80 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  56.76 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  54.67 
 
 
79 aa  92.8  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  55.41 
 
 
79 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  55.41 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  54.93 
 
 
92 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  50.65 
 
 
81 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  47.44 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  48.05 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  45.45 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  44 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  45.57 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  45.45 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  45.95 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  44 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  43.42 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  43.04 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  40.79 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  40.79 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  40.79 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  40.79 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  40.79 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  40.79 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.79 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  40.79 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  42.67 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  42.67 
 
 
87 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  42.67 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  42.67 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  42.67 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  40.79 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  40.79 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  40.79 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  36.84 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  42.67 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  40 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  39.76 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  36.84 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  37.5 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  37.5 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  35.53 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  40 
 
 
85 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  44 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  44 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  37.84 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  38.1 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  39.47 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  38.67 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  49.15 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  45.76 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  37.33 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  47.46 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  47.46 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  47.46 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  47.46 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  44.07 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  45.76 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  41.33 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  40.98 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  46.55 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  37.33 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  40.98 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  45.76 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  34.21 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  36 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  34.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>