More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2912 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  100 
 
 		 330 aa  665    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  74.83 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  73.06 
 
 		 328 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  67.4 
 
 		 319 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  65.08 
 
 		 316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  64.13 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  53.7 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  48.66 
 
 		 340 aa  321  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  43.71 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  55.06 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  53.08 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  53.97 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  48.28 
 
 		 288 aa  222  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  44.22 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  45.98 
 
 		 288 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.39 
 
 		 369 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.91 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  36.84 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  38.46 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  36.39 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.03 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  35.95 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  37 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  32.04 
 
 		 318 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  52.41 
 
 		 394 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  37.08 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  36.44 
 
 		 299 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.13 
 
 		 423 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  36.53 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  33.09 
 
 		 299 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  49.06 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  33.02 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.24 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.96 
 
 		 299 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  34.76 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  36.99 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  36.99 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  36.99 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  35.19 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  36.53 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  39.29 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  36.57 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  36.57 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  54.41 
 
 		 459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  36.57 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  36.57 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  53.68 
 
 		 455 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.72 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  51.47 
 
 		 457 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.24 
 
 		 455 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  49.62 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  37.1 
 
 		 391 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  38.73 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  49.63 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  50 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  41.1 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 		 453 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.72 
 
 		 399 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.44 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  31.25 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  39.67 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.9 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  36.86 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.08 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.93 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  47.62 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.95 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.27 
 
 		 233 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.38 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  37.39 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.29 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  48.15 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  31.19 
 
 		 292 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  29.52 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.99 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  36.53 
 
 		 305 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  38.79 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  47.29 
 
 		 414 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  46.46 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  53.1 
 
 		 541 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.21 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.14 
 
 		 452 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.73 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  47.41 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.88 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.87 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.46 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  31.79 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.74 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  45 
 
 		 413 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.36 
 
 		 450 aa  116  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.48 
 
 		 304 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  36.29 
 
 		 443 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  29.56 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  34.62 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.02 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>