223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2862 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  100 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  45.73 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  40.74 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  45.02 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  38.36 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  37.61 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  34.25 
 
 		 224 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  38.99 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  43.75 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  32.18 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  40 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  35.81 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  38.02 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  40.19 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  41.12 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  41.48 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  34.36 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  37.06 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  40.7 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  36.56 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  35.39 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  37.62 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  40 
 
 		 245 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  36.75 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  36.45 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.75 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  31.15 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  34.62 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  35.15 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  32.89 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  35.54 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0523  AzlC family protein  34.03 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3176  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like  37.07 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  36.59 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  31.47 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  38.59 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  35.36 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  30.23 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  39.77 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  29.53 
 
 		 230 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  34.55 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  36.31 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  33.79 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.16 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  31.1 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  33.33 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13200  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.78 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.754483 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  31.85 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  33.79 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  31.85 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.31 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  30.8 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  31.58 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  44.55 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  31.11 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  32.34 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  31.11 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  34.48 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  34.78 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  30.81 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  34.08 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3065  AzlC family protein  38.1 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  30.37 
 
 		 248 aa  72  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  31.74 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  30.16 
 
 		 238 aa  72  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  30.72 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  33.54 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  39.31 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  31.93 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  32.3 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  31.93 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  31.93 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  37.79 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  25 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  35.81 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  30.85 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4228  hypothetical protein  34.1 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.988743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  32.97 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  34.07 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  31.72 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  31.72 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  31.72 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  35.63 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  31.72 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15010  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  34.81 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.509076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.09 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  30.36 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  30.15 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0849  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.19 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000903381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  33.11 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  36.28 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06980  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.95 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000303434  normal  0.415503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>